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Python ScreedDB.itervalues方法代码示例

本文整理汇总了Python中screed.ScreedDB.itervalues方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python ScreedDB.itervalues方法的具体用法?Python ScreedDB.itervalues怎么用?Python ScreedDB.itervalues使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在screed.ScreedDB的用法示例。


在下文中一共展示了ScreedDB.itervalues方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: range

# 需要导入模块: from screed import ScreedDB [as 别名]
# 或者: from screed.ScreedDB import itervalues [as 别名]
            for i in range(0, len(str(virus_seq))):
                if str(read[i]) != str(virus_seq[i]):
                    mismatch_count += 1
                elif mismatch_count > k:
                    break
            return mismatch_count
                

            # EXAMPLE:

            #   CGTAGCGATAGAGAGAGAAGGGACT 
            #   CTGAG

birnaxrecords = []
a=0
for record in birna_x_virusdb.itervalues():
    birnaxrecords.append(record)
    #print "\nPrinting added record\n"
    #print record['sequence']
    birnaxrecords[a]['sequence'] = str(record['sequence'])
    a+=1

print birnaxrecords
#typing: $ records
#   PRODUCES: [{'description': 'Drosophila melanogaster birnavirus SW-2009a strain DBV segment A, complete sequence', 'id': 0, 'name': 'gi|262225302|gb|GQ342962.1|', 'sequence': <_screed_attr 'sequence'>}, {'description': 'Drosophila melanogaster birnavirus SW-2009a strain DBV segment B, complete sequence', 'id': 1, 'name': 'gi|262225305|gb|GQ342963.1|', 'sequence': <_screed_attr 'sequence'>}]
#len(record['sequence'])
#   3014
#record['sequence']
#   <_screed_attr 'sequence'>
print "\n\n\n"
#print "Printing a count: all birna records (should equal to 2)...\n"
开发者ID:NacroKill,项目名称:dmel-ercc-diff,代码行数:33,代码来源:Tophat_Birnavirus_Confirmer_2.0.py


注:本文中的screed.ScreedDB.itervalues方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。