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Python RMGDatabase.forbiddenStructures方法代码示例

本文整理汇总了Python中rmgpy.data.rmg.RMGDatabase.forbiddenStructures方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python RMGDatabase.forbiddenStructures方法的具体用法?Python RMGDatabase.forbiddenStructures怎么用?Python RMGDatabase.forbiddenStructures使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在rmgpy.data.rmg.RMGDatabase的用法示例。


在下文中一共展示了RMGDatabase.forbiddenStructures方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: setUpModule

# 需要导入模块: from rmgpy.data.rmg import RMGDatabase [as 别名]
# 或者: from rmgpy.data.rmg.RMGDatabase import forbiddenStructures [as 别名]
def setUpModule():
    """A function that is run ONCE before all unit tests in this module."""
    global database
    database = RMGDatabase()
    database.load(
        path=os.path.join(settings['test_data.directory'], 'testing_database'),
        thermoLibraries=['primaryThermoLibrary'],
        reactionLibraries=['GRI-Mech3.0'],
        kineticsFamilies=[
            'R_Recombination',
            'Disproportionation',
            'R_Addition_MultipleBond',
            'H_Abstraction',
            'intra_H_migration',
        ],
        testing=True,
        depository=False,
        solvation=False,
    )
    #load empty forbidden structures to avoid any dependence on forbidden structures
    #for these tests
    for family in database.kinetics.families.values():
        family.forbidden = ForbiddenStructures()
    database.forbiddenStructures = ForbiddenStructures()

    # Prepare the database by loading training reactions and averaging the rate rules
    for family in database.kinetics.families.values():
        family.addKineticsRulesFromTrainingSet(thermoDatabase=database.thermo)
        family.fillKineticsRulesByAveragingUp(verbose=True)
开发者ID:ReactionMechanismGenerator,项目名称:RMG-Py,代码行数:31,代码来源:kineticsTest.py


注:本文中的rmgpy.data.rmg.RMGDatabase.forbiddenStructures方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。