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Python Samfile.next方法代码示例

本文整理汇总了Python中pysam.Samfile.next方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Samfile.next方法的具体用法?Python Samfile.next怎么用?Python Samfile.next使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pysam.Samfile的用法示例。


在下文中一共展示了Samfile.next方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: bam_read_id

# 需要导入模块: from pysam import Samfile [as 别名]
# 或者: from pysam.Samfile import next [as 别名]
def bam_read_id(url):
    '''Read first read id out of a remote bam file.

    Note: requires a patched version of pysam
    '''
    stream = Samfile(url, 'rb')
    read = stream.next()
    return read.qname
开发者ID:detrout,项目名称:encode3-curation,代码行数:10,代码来源:validate_encode3_aliases.py


注:本文中的pysam.Samfile.next方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。