本文整理汇总了Python中pymbar.MBAR.computeExpectationsInner方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python MBAR.computeExpectationsInner方法的具体用法？Python MBAR.computeExpectationsInner怎么用？Python MBAR.computeExpectationsInner使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pymbar.MBAR的用法示例。
在下文中一共展示了MBAR.computeExpectationsInner方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_mbar_computeExpectationsInner
# 需要导入模块: from pymbar import MBAR [as 别名]
# 或者: from pymbar.MBAR import computeExpectationsInner [as 别名]
def test_mbar_computeExpectationsInner():
"""Can MBAR calculate general expectations inner code (note: this just tests completion)"""
for system_generator in system_generators:
name, test = system_generator()
x_n, u_kn, N_k_output, s_n = test.sample(N_k, mode='u_kn')
eq(N_k, N_k_output)
mbar = MBAR(u_kn, N_k)
A_in = np.array([x_n, x_n ** 2, x_n ** 3])
u_n = u_kn[:2,:]
state_map = np.array([[0,0],[1,0],[2,0],[2,1]],int)
[A_i, d2A_ij] = mbar.computeExpectationsInner(A_in, u_n, state_map)