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Python VaspInput.write_input方法代码示例

本文整理汇总了Python中pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput.write_input方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python VaspInput.write_input方法的具体用法?Python VaspInput.write_input怎么用?Python VaspInput.write_input使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput的用法示例。


在下文中一共展示了VaspInput.write_input方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: VaspInputTest

# 需要导入模块: from pymatgen.io.vaspio.vasp_input import VaspInput [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput import write_input [as 别名]
class VaspInputTest(unittest.TestCase):

    def setUp(self):
        filepath = os.path.join(test_dir, 'INCAR')
        incar = Incar.from_file(filepath)
        filepath = os.path.join(test_dir, 'POSCAR')
        poscar = Poscar.from_file(filepath)
        if "VASP_PSP_DIR" not in os.environ:
            test_potcar_dir = os.path.abspath(
                os.path.join(os.path.dirname(__file__), "..", "..", "..", "..",
                             "test_files"))
            os.environ["VASP_PSP_DIR"] = test_potcar_dir
        filepath = os.path.join(test_dir, 'POTCAR')
        potcar = Potcar.from_file(filepath)
        filepath = os.path.join(test_dir, 'KPOINTS.auto')
        kpoints = Kpoints.from_file(filepath)
        self.vinput = VaspInput(incar, kpoints, poscar, potcar)

    def test_to_from_dict(self):
        d = self.vinput.as_dict()
        vinput = VaspInput.from_dict(d)
        comp = vinput["POSCAR"].structure.composition
        self.assertEqual(comp, Composition("Fe4P4O16"))

    def test_write(self):
        tmp_dir = "VaspInput.testing"
        self.vinput.write_input(tmp_dir)

        filepath = os.path.join(tmp_dir, "INCAR")
        incar = Incar.from_file(filepath)
        self.assertEqual(incar["NSW"], 99)

        for name in ("INCAR", "POSCAR", "POTCAR", "KPOINTS"):
            os.remove(os.path.join(tmp_dir, name))

        os.rmdir(tmp_dir)

    def test_from_directory(self):
        vi = VaspInput.from_directory(test_dir,
                                      optional_files={"CONTCAR.Li2O": Poscar})
        self.assertEqual(vi["INCAR"]["ALGO"], "Damped")
        self.assertIn("CONTCAR.Li2O", vi)
        d = vi.as_dict()
        vinput = VaspInput.from_dict(d)
        self.assertIn("CONTCAR.Li2O", vinput)
开发者ID:ychaojia,项目名称:pymatgen,代码行数:47,代码来源:test_vasp_input.py


注:本文中的pymatgen.io.vaspio.vasp_input.VaspInput.write_input方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。