本文整理汇总了Python中pymatgen.io.vasp.outputs.Outcar.read_table_pattern方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Outcar.read_table_pattern方法的具体用法?Python Outcar.read_table_pattern怎么用?Python Outcar.read_table_pattern使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pymatgen.io.vasp.outputs.Outcar
的用法示例。
在下文中一共展示了Outcar.read_table_pattern方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: forces_from_outcar
# 需要导入模块: from pymatgen.io.vasp.outputs import Outcar [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vasp.outputs.Outcar import read_table_pattern [as 别名]
def forces_from_outcar( filename='OUTCAR' ):
"""Finds and returns forces from the OUTCAR file.
Args:
filename (:obj:'str', optional): the name of the ``OUTCAR`` file to be read. Default is `OUTCAR`.
Returns:
(np.array): The force as found in the ``OUTCAR`` file, as a NSTEPS x NIONS x 3 numpy array.
"""
outcar = Outcar("OUTCAR")
forces = outcar.read_table_pattern(
header_pattern=r"\sPOSITION\s+TOTAL-FORCE \(eV/Angst\)\n\s-+",
row_pattern=r"\s+[+-]?\d+\.\d+\s+[+-]?\d+\.\d+\s+[+-]?\d+\.\d+\s+([+-]?\d+\.\d+)\s+([+-]?\d+\.\d+)\s+([+-]?\d+\.\d+)",
footer_pattern=r"\s--+",
postprocess=lambda x: float(x),
last_one_only=False
)
return np.array( forces )