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Python Outcar.read_table_pattern方法代码示例

本文整理汇总了Python中pymatgen.io.vasp.outputs.Outcar.read_table_pattern方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Outcar.read_table_pattern方法的具体用法?Python Outcar.read_table_pattern怎么用?Python Outcar.read_table_pattern使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pymatgen.io.vasp.outputs.Outcar的用法示例。


在下文中一共展示了Outcar.read_table_pattern方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: forces_from_outcar

# 需要导入模块: from pymatgen.io.vasp.outputs import Outcar [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.vasp.outputs.Outcar import read_table_pattern [as 别名]
def forces_from_outcar( filename='OUTCAR' ):
    """Finds and returns forces from the OUTCAR file.
      
    Args:
        filename (:obj:'str', optional): the name of the ``OUTCAR`` file to be read. Default is `OUTCAR`.

    Returns:
        (np.array): The force as found in the ``OUTCAR`` file, as a NSTEPS x NIONS x 3 numpy array.

    """
    outcar = Outcar("OUTCAR")
    forces = outcar.read_table_pattern(
        header_pattern=r"\sPOSITION\s+TOTAL-FORCE \(eV/Angst\)\n\s-+",
        row_pattern=r"\s+[+-]?\d+\.\d+\s+[+-]?\d+\.\d+\s+[+-]?\d+\.\d+\s+([+-]?\d+\.\d+)\s+([+-]?\d+\.\d+)\s+([+-]?\d+\.\d+)",
        footer_pattern=r"\s--+",
        postprocess=lambda x: float(x),
        last_one_only=False
    )
    return np.array( forces )
开发者ID:bjmorgan,项目名称:vasppy,代码行数:21,代码来源:outcar.py


注:本文中的pymatgen.io.vasp.outputs.Outcar.read_table_pattern方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。