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Python NwTask.as_dict方法代码示例

本文整理汇总了Python中pymatgen.io.nwchem.NwTask.as_dict方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python NwTask.as_dict方法的具体用法?Python NwTask.as_dict怎么用?Python NwTask.as_dict使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pymatgen.io.nwchem.NwTask的用法示例。


在下文中一共展示了NwTask.as_dict方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: NwTaskTest

# 需要导入模块: from pymatgen.io.nwchem import NwTask [as 别名]
# 或者: from pymatgen.io.nwchem.NwTask import as_dict [as 别名]
class NwTaskTest(unittest.TestCase):

    def setUp(self):
        self.task = NwTask(0, 1, basis_set={"H": "6-31g"}, theory="dft",
                           theory_directives={"xc": "b3lyp"})
        self.task_cosmo = NwTask(0, 1, basis_set={"H": "6-31g"}, theory="dft",
                                 theory_directives={"xc": "b3lyp"},
                                 alternate_directives={'cosmo': "cosmo"})
        self.task_esp = NwTask(0, 1, basis_set={"H": "6-31g"}, theory="esp")

    def test_multi_bset(self):
        t = NwTask.from_molecule(
            mol, theory="dft", basis_set={"C": "6-311++G**",
                                          "H": "6-31++G**"},
            theory_directives={"xc": "b3lyp"})
        ans = """title "H4C1 dft optimize"
charge 0
basis
 C library "6-311++G**"
 H library "6-31++G**"
end
dft
 xc b3lyp
end
task dft optimize"""
        self.assertEqual(str(t), ans)

    def test_str_and_from_string(self):

        ans = """title "dft optimize"
charge 0
basis
 H library "6-31g"
end
dft
 xc b3lyp
end
task dft optimize"""
        self.assertEqual(str(self.task), ans)

    def test_to_from_dict(self):
        d = self.task.as_dict()
        t = NwTask.from_dict(d)
        self.assertIsInstance(t, NwTask)

    def test_init(self):
        self.assertRaises(NwInputError, NwTask, 0, 1, {"H": "6-31g"},
                          theory="bad")
        self.assertRaises(NwInputError, NwTask, 0, 1, {"H": "6-31g"},
                          operation="bad")

    def test_dft_task(self):
        task = NwTask.dft_task(mol, charge=1, operation="energy")
        ans = """title "H4C1 dft energy"
charge 1
basis
 C library "6-31g"
 H library "6-31g"
end
dft
 mult 2
 xc b3lyp
end
task dft energy"""
        self.assertEqual(str(task), ans)

    def test_dft_cosmo_task(self):
        task = NwTask.dft_task(
            mol, charge=mol.charge, operation="energy",
            xc="b3lyp", basis_set="6-311++G**",
            alternate_directives={'cosmo': {"dielec": 78.0}})
        ans = """title "H4C1 dft energy"
charge 0
basis
 C library "6-311++G**"
 H library "6-311++G**"
end
dft
 mult 1
 xc b3lyp
end
cosmo
 dielec 78.0
end
task dft energy"""
        self.assertEqual(str(task), ans)

    def test_esp_task(self):
        task = NwTask.esp_task(mol, charge=mol.charge, operation="",
                               basis_set="6-311++G**")
        ans = """title "H4C1 esp "
charge 0
basis
 C library "6-311++G**"
 H library "6-311++G**"
end

task esp """
        self.assertEqual(str(task), ans)
开发者ID:sonium0,项目名称:pymatgen,代码行数:101,代码来源:test_nwchem.py


注:本文中的pymatgen.io.nwchem.NwTask.as_dict方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。