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Python TransformedStructure.from_dict方法代码示例

本文整理汇总了Python中pymatgen.alchemy.materials.TransformedStructure.from_dict方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TransformedStructure.from_dict方法的具体用法?Python TransformedStructure.from_dict怎么用?Python TransformedStructure.from_dict使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pymatgen.alchemy.materials.TransformedStructure的用法示例。


在下文中一共展示了TransformedStructure.from_dict方法的3个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_from_dict

# 需要导入模块: from pymatgen.alchemy.materials import TransformedStructure [as 别名]
# 或者: from pymatgen.alchemy.materials.TransformedStructure import from_dict [as 别名]
 def test_from_dict(self):
     d = json.load(open(os.path.join(test_dir, "transformations.json"), "r"))
     d["other_parameters"] = {"tags": ["test"]}
     ts = TransformedStructure.from_dict(d)
     ts.other_parameters["author"] = "Will"
     ts.append_transformation(SubstitutionTransformation({"Fe": "Mn"}))
     self.assertEqual("MnPO4", ts.final_structure.composition.reduced_formula)
     self.assertEqual(ts.other_parameters, {"author": "Will", "tags": ["test"]})
开发者ID:shyamd,项目名称:pymatgen,代码行数:10,代码来源:test_materials.py

示例2: test_from_dict

# 需要导入模块: from pymatgen.alchemy.materials import TransformedStructure [as 别名]
# 或者: from pymatgen.alchemy.materials.TransformedStructure import from_dict [as 别名]
 def test_from_dict(self):
     d = json.load(open(os.path.join(test_dir, 'transformations.json'), 'r'))
     d['other_parameters'] = {'tags': ['test']}
     ts = TransformedStructure.from_dict(d)
     ts.set_parameter('author', 'Will')
     ts.append_transformation(SubstitutionTransformation({"Fe":"Mn"}))
     self.assertEqual("MnPO4", ts.final_structure.composition.reduced_formula)
     self.assertEqual(ts.other_parameters, {'author': 'Will', 'tags': ['test']})
开发者ID:chenweis,项目名称:pymatgen,代码行数:10,代码来源:test_materials.py

示例3: CifParser

# 需要导入模块: from pymatgen.alchemy.materials import TransformedStructure [as 别名]
# 或者: from pymatgen.alchemy.materials.TransformedStructure import from_dict [as 别名]
excluded_bonding_elements = args.exclude_bonding[0].split(',') if args.exclude_bonding else []

file_format = args.format
filename = args.input_file[0]

s = None

if filename.endswith(".cif"):
    file_format = "cif"
elif filename.startswith("POSCAR"):
    file_format = "poscar"
elif re.search('\.json', filename):
    file_format = 'mpjson'


if file_format == 'poscar':
    p = Poscar.from_file(filename)
    s = p.struct
elif file_format == 'cif':
    r = CifParser(filename)
    s = r.get_structures(False)[0]
else:
    d = json.load(file_open_zip_aware(filename))
    ts = TransformedStructure.from_dict(d)
    s = ts.final_structure

if s:
    vis = StructureVis(excluded_bonding_elements=excluded_bonding_elements)
    vis.set_structure(s)
    vis.show()
开发者ID:chenweis,项目名称:pymatgen,代码行数:32,代码来源:vis_structure.py


注:本文中的pymatgen.alchemy.materials.TransformedStructure.from_dict方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。