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Python SequenceFileDB.filepath方法代码示例

本文整理汇总了Python中pygr.seqdb.SequenceFileDB.filepath方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python SequenceFileDB.filepath方法的具体用法?Python SequenceFileDB.filepath怎么用?Python SequenceFileDB.filepath使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pygr.seqdb.SequenceFileDB的用法示例。


在下文中一共展示了SequenceFileDB.filepath方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_basic_iadd

# 需要导入模块: from pygr.seqdb import SequenceFileDB [as 别名]
# 或者: from pygr.seqdb.SequenceFileDB import filepath [as 别名]
    def test_basic_iadd(self):
        dnaseq = testutil.datafile('dnaseq.fasta')
        seqdb = SequenceFileDB(dnaseq)
        try:
            new_seq = seqdb['seq1']

            self.db += new_seq

            assert new_seq in self.db
            name = (~self.db)[new_seq]
            assert name == 'dnaseq.seq1', name

            ###

            seqdb2 = SequenceFileDB(dnaseq)
            try:
                # Munge the filepath for testing.
                seqdb2.filepath = 'foo'
                new_seq2 = seqdb2['seq1']

                self.db += new_seq2
                name2 = (~self.db)[new_seq2]
                assert name2 == 'foo.seq1', name2
            finally:
                seqdb2.close()
        finally:
            seqdb.close()
开发者ID:Open-Technology,项目名称:Graph-Database,代码行数:29,代码来源:seqdb_test.py


注:本文中的pygr.seqdb.SequenceFileDB.filepath方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。