本文整理汇总了Python中pygr.seqdb.SequenceFileDB.filepath方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python SequenceFileDB.filepath方法的具体用法?Python SequenceFileDB.filepath怎么用?Python SequenceFileDB.filepath使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pygr.seqdb.SequenceFileDB
的用法示例。
在下文中一共展示了SequenceFileDB.filepath方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_basic_iadd
# 需要导入模块: from pygr.seqdb import SequenceFileDB [as 别名]
# 或者: from pygr.seqdb.SequenceFileDB import filepath [as 别名]
def test_basic_iadd(self):
dnaseq = testutil.datafile('dnaseq.fasta')
seqdb = SequenceFileDB(dnaseq)
try:
new_seq = seqdb['seq1']
self.db += new_seq
assert new_seq in self.db
name = (~self.db)[new_seq]
assert name == 'dnaseq.seq1', name
###
seqdb2 = SequenceFileDB(dnaseq)
try:
# Munge the filepath for testing.
seqdb2.filepath = 'foo'
new_seq2 = seqdb2['seq1']
self.db += new_seq2
name2 = (~self.db)[new_seq2]
assert name2 == 'foo.seq1', name2
finally:
seqdb2.close()
finally:
seqdb.close()