本文整理汇总了Python中oncotator.Annotator.Annotator.retrieve_transcript_by_id方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Annotator.retrieve_transcript_by_id方法的具体用法？Python Annotator.retrieve_transcript_by_id怎么用？Python Annotator.retrieve_transcript_by_id使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类oncotator.Annotator.Annotator的用法示例。
在下文中一共展示了Annotator.retrieve_transcript_by_id方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_simple_transcript_annotation
# 需要导入模块: from oncotator.Annotator import Annotator [as 别名]
# 或者: from oncotator.Annotator.Annotator import retrieve_transcript_by_id [as 别名]
def test_simple_transcript_annotation(self):
"""Test web api backend call /transcript/ """
# http://www.broadinstitute.org/oncotator/transcript/ENST00000215832.6/
datasource_list = DatasourceFactory.createDatasources(self._determine_db_dir(), "hg19", isMulticore=False)
annotator = Annotator()
for ds in datasource_list:
annotator.addDatasource(ds)
tx = annotator.retrieve_transcript_by_id("ENST00000215832.6")
self.assertTrue(tx is not None)
self.assertTrue(tx.get_gene() == "MAPK1")