本文整理汇总了Python中hgu.db.DbAccess.finalise方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python DbAccess.finalise方法的具体用法?Python DbAccess.finalise怎么用?Python DbAccess.finalise使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类hgu.db.DbAccess
的用法示例。
在下文中一共展示了DbAccess.finalise方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1:
# 需要导入模块: from hgu.db import DbAccess [as 别名]
# 或者: from hgu.db.DbAccess import finalise [as 别名]
"DB_DATABASE": None,
"DB_PASSWORD": None,
"OUTPUT_FILEPATH": None,
"PROJECT": None
}
configFile = sys.argv[1]
Util.readConfiguration(configFile, config, printConfig=True)
# process the PROJECT flag
if config["PROJECT"].lower() not in ["emap", "gudmap"]:
Util.fatalError(["Unrecognised PROJECT parameter: " + config["PROJECT"]])
Util.statusMessage(["Reading in anatomy database."])
Anatomy.initialise(sortProject = config["PROJECT"],
dbHost = config["DB_HOST"],
dbName = config["DB_DATABASE"],
dbUser = config["DB_USER"],
dbPass = config["DB_PASSWORD"],
outputFilePath = config["OUTPUT_FILEPATH"])
Util.statusMessage(["Generating SQL to repopulate derived tables."])
Anatomy.generateDerivedData()
DbAccess.finalise()
Util.statusMessage(["Done. SQL script is in " + config["OUTPUT_FILEPATH"]])
sys.exit(0)