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Python BlockMatrix.export_rectangles方法代码示例

本文整理汇总了Python中hail.linalg.BlockMatrix.export_rectangles方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python BlockMatrix.export_rectangles方法的具体用法?Python BlockMatrix.export_rectangles怎么用?Python BlockMatrix.export_rectangles使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在hail.linalg.BlockMatrix的用法示例。


在下文中一共展示了BlockMatrix.export_rectangles方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_export_rectangles

# 需要导入模块: from hail.linalg import BlockMatrix [as 别名]
# 或者: from hail.linalg.BlockMatrix import export_rectangles [as 别名]
    def test_export_rectangles(self):
        nd = np.arange(0, 80, dtype=float).reshape(8, 10)

        rects1 = [[0, 1, 0, 1], [4, 5, 7, 8]]

        rects2 = [[4, 5, 0, 10], [0, 8, 4, 5]]

        rects3 = [[0, 1, 0, 1], [1, 2, 1, 2], [2, 3, 2, 3],
                  [3, 5, 3, 6], [3, 6, 3, 7], [3, 7, 3, 8],
                  [4, 5, 0, 10], [0, 8, 4, 5], [0, 8, 0, 10]]

        for rects in [rects1, rects2, rects3]:
            for block_size in [3, 4, 10]:
                bm_uri = new_temp_file()
                rect_path = new_local_temp_dir()
                rect_uri = local_path_uri(rect_path)

                (BlockMatrix.from_numpy(nd, block_size=block_size)
                    .sparsify_rectangles(rects)
                    .write(bm_uri, force_row_major=True))

                BlockMatrix.export_rectangles(bm_uri, rect_uri, rects)

                for (i, r) in enumerate(rects):
                    file = rect_path + '/rect-' + str(i) + '_' + '-'.join(map(str, r))
                    expected = nd[r[0]:r[1], r[2]:r[3]]
                    actual = np.reshape(np.loadtxt(file), (r[1] - r[0], r[3] - r[2]))
                    self._assert_eq(expected, actual)

        bm_uri = new_temp_file()
        rect_uri = new_temp_file()

        (BlockMatrix.from_numpy(nd, block_size=5)
            .sparsify_rectangles([[0, 1, 0, 1]])
            .write(bm_uri, force_row_major=True))

        with self.assertRaises(FatalError) as e:
            BlockMatrix.export_rectangles(bm_uri, rect_uri, [[5, 6, 5, 6]])
            self.assertEquals(e.msg, 'block (1, 1) missing for rectangle 0 with bounds [5, 6, 5, 6]')
开发者ID:danking,项目名称:hail,代码行数:41,代码来源:test_linalg.py


注:本文中的hail.linalg.BlockMatrix.export_rectangles方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。