本文整理汇总了Python中flatfeature.Bed.mask_cds方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Bed.mask_cds方法的具体用法？Python Bed.mask_cds怎么用？Python Bed.mask_cds使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类flatfeature.Bed的用法示例。
在下文中一共展示了Bed.mask_cds方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: Bed
# 需要导入模块: from flatfeature import Bed [as 别名]
# 或者: from flatfeature.Bed import mask_cds [as 别名]
# write a genomic fasta file with all sequences covered by features
# in the specified Bed file masked to N.
from flatfeature import Bed
import sys
# b = Bed(sys.argv[1], sys.argv[2])
b = Bed("/Users/gturco/data/rice_v6.bed", "/Users/gturco/data/rice_v6.fasta")
for seqid, seq in b.mask_cds():
seqids = []
seq.tostring()