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Python TreeStyle.extra_branch_line_type方法代码示例

本文整理汇总了Python中ete2.TreeStyle.extra_branch_line_type方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TreeStyle.extra_branch_line_type方法的具体用法?Python TreeStyle.extra_branch_line_type怎么用?Python TreeStyle.extra_branch_line_type使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在ete2.TreeStyle的用法示例。


在下文中一共展示了TreeStyle.extra_branch_line_type方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: setTreeStyle

# 需要导入模块: from ete2 import TreeStyle [as 别名]
# 或者: from ete2.TreeStyle import extra_branch_line_type [as 别名]
def setTreeStyle(style, layoutfunction):
    #consolidate options for showing trees
    #pass in string "circle" or "rect" and a layout function
    I = TreeStyle()
    if style == "circle":
        I.tree_width = 1200
        I.layout_fn = layoutfunction
        I.show_branch_length = False
        #I.show_branch_support = True
        I.show_leaf_name = False
        I.mode = "c"
        I.force_topology = True
        #I.legend_position = 3
        I.extra_branch_line_type = 1
        I.guiding_lines_type = 1
        I.guiding_lines_color = "#666666"
        I.extra_branch_line_color = "#666666"
        I.optimal_scale_level = "full"
        I.root_opening_factor = 0
        
    elif style =="rect":
        I = TreeStyle()
        I.layout_fn = layoutfunction
        I.show_leaf_name = False
        I.force_topology = True
        I.optimal_scale_level = "semi"
        
    else:
        I.layout_fn = layoutfunction
        I.show_leaf_name = False
        I.force_topology = True
        I.optimal_scale_level = "semi"
    return I

    

    
开发者ID:michaelalfaro,项目名称:tools,代码行数:35,代码来源:phy_utils.py


注:本文中的ete2.TreeStyle.extra_branch_line_type方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。