本文整理汇总了Python中cadnano.strand.Strand.connection3p方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Strand.connection3p方法的具体用法?Python Strand.connection3p怎么用?Python Strand.connection3p使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类cadnano.strand.Strand
的用法示例。
在下文中一共展示了Strand.connection3p方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: __init__
# 需要导入模块: from cadnano.strand import Strand [as 别名]
# 或者: from cadnano.strand.Strand import connection3p [as 别名]
def __init__(self, strandset: StrandSetT, strand: Strand, solo: bool = True):
super(RemoveStrandCommand, self).__init__("remove strands")
self._strandset = strandset
self._strand = strand
self._solo = solo
self._old_strand5p = strand.connection5p()
self._old_strand3p = strand.connection3p()
self._oligo = olg = strand.oligo()
part = strand.part()
# idxs = strand.idxs()
self.mids = (part.getModID(strand, strand.lowIdx()),
part.getModID(strand, strand.highIdx()))
# only create a new 5p oligo if there is a 3' connection
self._new_oligo5p = olg.shallowCopy() if self._old_strand5p else None
if olg.isCircular() or self._old_strand3p is None:
self._new_oligo3p = olg3p = None
if self._new_oligo5p:
self._new_oligo5p._setLoop(False)
else:
self._new_oligo3p = olg3p = olg.shallowCopy()
olg3p.setStrand5p(self._old_strand3p)
# color_list = styles.STAP_COLORS if strandset.isStaple() else prefs.SCAF_COLORS
color_list = pathstyles.STAP_COLORS
color = random.choice(color_list)
olg3p._setColor(color)
olg3p.refreshLength(emit_signals=True)