当前位置: 首页>>代码示例>>Python>>正文


Python Strand.connection3p方法代码示例

本文整理汇总了Python中cadnano.strand.Strand.connection3p方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Strand.connection3p方法的具体用法?Python Strand.connection3p怎么用?Python Strand.connection3p使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在cadnano.strand.Strand的用法示例。


在下文中一共展示了Strand.connection3p方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: __init__

# 需要导入模块: from cadnano.strand import Strand [as 别名]
# 或者: from cadnano.strand.Strand import connection3p [as 别名]
    def __init__(self, strandset: StrandSetT, strand: Strand, solo: bool = True):
        super(RemoveStrandCommand, self).__init__("remove strands")
        self._strandset = strandset
        self._strand = strand
        self._solo = solo
        self._old_strand5p = strand.connection5p()
        self._old_strand3p = strand.connection3p()
        self._oligo = olg = strand.oligo()

        part = strand.part()
        # idxs = strand.idxs()
        self.mids = (part.getModID(strand, strand.lowIdx()),
                     part.getModID(strand, strand.highIdx()))

        # only create a new 5p oligo if there is a 3' connection
        self._new_oligo5p = olg.shallowCopy() if self._old_strand5p else None
        if olg.isCircular() or self._old_strand3p is None:
            self._new_oligo3p = olg3p = None
            if self._new_oligo5p:
                self._new_oligo5p._setLoop(False)
        else:
            self._new_oligo3p = olg3p = olg.shallowCopy()
            olg3p.setStrand5p(self._old_strand3p)
            # color_list = styles.STAP_COLORS if strandset.isStaple() else prefs.SCAF_COLORS
            color_list = pathstyles.STAP_COLORS
            color = random.choice(color_list)
            olg3p._setColor(color)
            olg3p.refreshLength(emit_signals=True)
开发者ID:cadnano,项目名称:cadnano2.5,代码行数:30,代码来源:removestrandcmd.py


注:本文中的cadnano.strand.Strand.connection3p方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。