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Python VelocityVerlet.state_label方法代码示例

本文整理汇总了Python中ase.md.verlet.VelocityVerlet.state_label方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python VelocityVerlet.state_label方法的具体用法?Python VelocityVerlet.state_label怎么用?Python VelocityVerlet.state_label使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在ase.md.verlet.VelocityVerlet的用法示例。


在下文中一共展示了VelocityVerlet.state_label方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: MaxwellBoltzmannDistribution

# 需要导入模块: from ase.md.verlet import VelocityVerlet [as 别名]
# 或者: from ase.md.verlet.VelocityVerlet import state_label [as 别名]
  # simT, by the virial theorem
  if params.test_mode:
      np.random.seed(0) # use same random seed each time to be deterministic 
  if params.rescale_velo:
      MaxwellBoltzmannDistribution(atoms, 2.0*sim_T)
  # Save frames to the trajectory every `traj_interval` time steps
  # but only when interpolating
  trajectory = AtomsWriter(os.path.join(params.rundir, params.traj_file))
  # Initialise the dynamical system
  system_timer('init_dynamics')
  if params.extrapolate_steps == 1:
      dynamics = VelocityVerlet(atoms, params.timestep)
      check_force_error = False
      if not params.classical:
          qmmm_pot.set(calc_weights=True)
      dynamics.state_label = 'D'
  else:
    print 'Initializing LOTF Dynamics'
    dynamics = LOTFDynamics(atoms, params.timestep,
                            params.extrapolate_steps,
                            check_force_error=check_force_error)
  system_timer('init_dynamics')
#Function to update the QM region at the beginning of each extrapolation cycle   
  if not check_force_error:
      if params.extrapolate_steps == 1:
          if not params.classical:
              dynamics.attach(update_qm_region, 1, dynamics.atoms)
      else:
      # choose appropriate update function for defects or crack.
      # or grainboundary.
        print 'Setting Update Function'
开发者ID:Montmorency,项目名称:fracture,代码行数:33,代码来源:run_qmmm.py


注:本文中的ase.md.verlet.VelocityVerlet.state_label方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。