本文整理汇总了Python中Translator.Translator.cifToAtomAndCoordinateList方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Translator.cifToAtomAndCoordinateList方法的具体用法？Python Translator.cifToAtomAndCoordinateList怎么用？Python Translator.cifToAtomAndCoordinateList使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Translator.Translator的用法示例。
在下文中一共展示了Translator.cifToAtomAndCoordinateList方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: error
# 需要导入模块: from Translator import Translator [as 别名]
# 或者: from Translator.Translator import cifToAtomAndCoordinateList [as 别名]
except IOError, (errno, strerror):
print "I/O error(%s): %s" % (errno, strerror)
string = ifile.readlines()
cell_params = []
cell_dict = {}
for parser in cell_parsers:
for data, dataStart, dataEnd in parser.scanString(string):
cell_params.append(data[1])
cell_dict[data[0]]=data[1]
ifile.close()
### end of fix
t=Translator()
t.filenameIn = fileInString
ciflist = t.cifToAtomAndCoordinateList()
cellvectors = MInv(cell_params)
uc = UnitCell(cellvectors)
for item in ciflist:
X = item[0]
pos = [float(x) for x in item[1:4]]
uc.addAtom(Atom(symbol=X), pos, "")
# Note: this only works if elements' symbols in CIF are "Ab" format