本文整理汇总了Python中SOAPpy.SOAPProxy.listPathways方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python SOAPProxy.listPathways方法的具体用法？Python SOAPProxy.listPathways怎么用？Python SOAPProxy.listPathways使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类SOAPpy.SOAPProxy的用法示例。
在下文中一共展示了SOAPProxy.listPathways方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: SOAPProxy
# 需要导入模块: from SOAPpy import SOAPProxy [as 别名]
# 或者: from SOAPpy.SOAPProxy import listPathways [as 别名]
if __name__ == "__main__":
parser = argparse.ArgumentParser()
parser.add_argument('-o', "--outdir")
parser.add_argument('-t', "--translate")
parser.add_argument('-b', "--biopax", action="store_true", default=False)
parser.add_argument("-v", "--verbose", action="store_true", default=False)
parser.add_argument("-f", "--file-mode", action="store_true", default=False)
parser.add_argument("pathways", nargs="*")
args = parser.parse_args()
server = SOAPProxy(url, namespace)
if len(args.pathways) == 0:
pathways = []
for row in server.listPathways():
if row['species'] == "Homo sapiens":
pathways.append(row['id'])
else:
pathways = args.pathways
translate_table = None
if args.translate:
handle = open(args.translate)
reader = csv.DictReader(handle, delimiter="\t")
translate_table = []
for row in reader:
translate_table.append(row)
handle.close()
if args.file_mode: