本文整理汇总了Python中Interval.Interval.contains方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Interval.contains方法的具体用法？Python Interval.contains怎么用？Python Interval.contains使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Interval.Interval的用法示例。
在下文中一共展示了Interval.contains方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: print
# 需要导入模块: from Interval import Interval [as 别名]
# 或者: from Interval.Interval import contains [as 别名]
else:
if(siteType=="donor"):
begin=exons[exonIndex-1].getEnd()
pos=exon.getBegin()-2
end=exon.getEnd()
else:
begin=exon.getBegin()
pos=exon.getEnd()
end=exons[exonIndex+1].getBegin()
exclusions=exclude.get(substrate,{})
begin=int(begin); pos=int(pos); end=int(end)
interval=Interval(pos-70,pos+70)
if(interval.begin<begin): interval.begin=begin
if(interval.end>end): interval.end=end
juncs=junctions.get(substrate,[])
#print("substrate=",substrate)
sum=0
for junc in juncs:
(substrate,begin,end,count)=junc
key=str(begin)+"-"+str(end)
if(exclusions.get(key,False)):
continue
if(interval.contains(begin) or interval.contains(end)): sum+=int(count)
geneCount=readCounts.get(geneID,0)
#print("gene=",geneID)
if(rex.find("(\S+)_\d",geneID)): geneID=rex[1]
print(indiv,hap,geneID,transID,strand,exonIndex,siteType,interval.begin,pos,
interval.end,sum,geneCount,totalMappedReads,sep="\t",flush=True)