本文整理汇总了Python中CGATPipelines.PipelineIDR.countPeaks方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PipelineIDR.countPeaks方法的具体用法?Python PipelineIDR.countPeaks怎么用?Python PipelineIDR.countPeaks使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类CGATPipelines.PipelineIDR
的用法示例。
在下文中一共展示了PipelineIDR.countPeaks方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: summarizePeaksForPooledPseudoreplicates
# 需要导入模块: from CGATPipelines import PipelineIDR [as 别名]
# 或者: from CGATPipelines.PipelineIDR import countPeaks [as 别名]
def summarizePeaksForPooledPseudoreplicates(infiles, outfile):
outf = IOTools.openFile(outfile, "w")
outf.write("Sample_id\t"
"Experiment\t"
"Tissue\t"
"Condition\t"
"Pseudoreplicate\t"
"n_peaks\n")
IDR.countPeaks(infiles, outf)