本文整理汇总了Python中Bio.ExPASy.get_prosite_raw方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python ExPASy.get_prosite_raw方法的具体用法？Python ExPASy.get_prosite_raw怎么用？Python ExPASy.get_prosite_raw使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Bio.ExPASy的用法示例。
在下文中一共展示了ExPASy.get_prosite_raw方法的3个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: __init__
# 需要导入模块: from Bio import ExPASy [as 别名]
# 或者: from Bio.ExPASy import get_prosite_raw [as 别名]
def __init__(self, s=None, ps=None):
if isinstance(s, basestring):
self.sequence = Seq(s)
else:
self.sequence = s
self.prosite = ExPASy.get_prosite_raw(ps)
self.record = Prosite.read(self.prosite)
self.pat = pa.compile(self.record.pattern)
self.regexp = re.compile(pa.prosite_to_re(self.record.pattern))示例2: test_prodoc_raw
# 需要导入模块: from Bio import ExPASy [as 别名]
# 或者: from Bio.ExPASy import get_prosite_raw [as 别名]
def test_prodoc_raw(self):
handle = ExPASy.get_prosite_raw('PDOC00001')
record = Prodoc.read(handle)
handle.close()
self.assertEqual(record.accession, 'PDOC00001')示例3: test_prosite_raw
# 需要导入模块: from Bio import ExPASy [as 别名]
# 或者: from Bio.ExPASy import get_prosite_raw [as 别名]
def test_prosite_raw(self):
handle = ExPASy.get_prosite_raw('PS00001')
record = Prosite.read(handle)
handle.close()
self.assertEqual(record.accession, 'PS00001')
self.assertEqual(record.name, 'ASN_GLYCOSYLATION')