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Python System.create_system方法代码示例

本文整理汇总了Python中System.create_system方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python System.create_system方法的具体用法?Python System.create_system怎么用?Python System.create_system使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在System的用法示例。


在下文中一共展示了System.create_system方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: run

# 需要导入模块: import System [as 别名]
# 或者: from System import create_system [as 别名]
            polymers.append(poly)
            
        except Exception, e:
            logger.exception(e)
            fh.close()
            logger.removeHandler(fh)
            logger.removeHandler(ch)
    
    if np.any(params.box_grid_shape==0):
        logger.warning("\n> no box size information provided, skipping system generation...")
        fh.close()
        logger.removeHandler(fh)
        logger.removeHandler(ch)
        return
    
    if params.mode=="gromacs":
        logger.info("\n> generating system...\n")
        system=System(polymers,ff,params)
        system.create_system(mypath=folder)
    
    
    logger.info("\n> All done! Thank you for using Assemble! <")
    fh.close()
    logger.removeHandler(fh)
    logger.removeHandler(ch)
    
if __name__=="__main__":
    #get database filename
    #infile="input_tmp"
    infile=str(sys.argv[2])
    run(infile)    
开发者ID:jostasche,项目名称:assemble,代码行数:33,代码来源:Assemble.py


注:本文中的System.create_system方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。