本文整理汇总了Python中System.create_system方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python System.create_system方法的具体用法?Python System.create_system怎么用?Python System.create_system使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类System
的用法示例。
在下文中一共展示了System.create_system方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: run
# 需要导入模块: import System [as 别名]
# 或者: from System import create_system [as 别名]
polymers.append(poly)
except Exception, e:
logger.exception(e)
fh.close()
logger.removeHandler(fh)
logger.removeHandler(ch)
if np.any(params.box_grid_shape==0):
logger.warning("\n> no box size information provided, skipping system generation...")
fh.close()
logger.removeHandler(fh)
logger.removeHandler(ch)
return
if params.mode=="gromacs":
logger.info("\n> generating system...\n")
system=System(polymers,ff,params)
system.create_system(mypath=folder)
logger.info("\n> All done! Thank you for using Assemble! <")
fh.close()
logger.removeHandler(fh)
logger.removeHandler(ch)
if __name__=="__main__":
#get database filename
#infile="input_tmp"
infile=str(sys.argv[2])
run(infile)