当前位置: 首页>>代码示例>>Python>>正文


Python SampleData.dataframe_from_weights方法代码示例

本文整理汇总了Python中SampleData.dataframe_from_weights方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python SampleData.dataframe_from_weights方法的具体用法?Python SampleData.dataframe_from_weights怎么用?Python SampleData.dataframe_from_weights使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在SampleData的用法示例。


在下文中一共展示了SampleData.dataframe_from_weights方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_load_model

# 需要导入模块: import SampleData [as 别名]
# 或者: from SampleData import dataframe_from_weights [as 别名]
    def test_load_model(self):
        snp_model = PredictionModel.load_model("tests/_td/dbs/test_1.db")

        e_e = SampleData.dataframe_from_extra(SampleData.sample_extra_2())
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.extra[PredictionModel.WDBEQF.K_GENE], e_e[PredictionModel.WDBEQF.K_GENE])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.extra[PredictionModel.WDBEQF.K_GENE_NAME], e_e[PredictionModel.WDBEQF.K_GENE_NAME])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.extra[PredictionModel.WDBEQF.K_N_SNP_IN_MODEL], e_e[PredictionModel.WDBEQF.K_N_SNP_IN_MODEL])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.extra[PredictionModel.WDBEQF.K_PRED_PERF_R2], e_e[PredictionModel.WDBEQF.K_PRED_PERF_R2])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.extra[PredictionModel.WDBEQF.K_PRED_PERF_PVAL], e_e[PredictionModel.WDBEQF.K_PRED_PERF_PVAL])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.extra[PredictionModel.WDBEQF.K_PRED_PERF_QVAL], e_e[PredictionModel.WDBEQF.K_PRED_PERF_QVAL])

        e_w = SampleData.dataframe_from_weights(SampleData.sample_weights_2())
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.weights[PredictionModel.WDBQF.K_RSID], e_w[PredictionModel.WDBQF.K_RSID])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.weights[PredictionModel.WDBQF.K_GENE], e_w[PredictionModel.WDBQF.K_GENE])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.weights[PredictionModel.WDBQF.K_WEIGHT], e_w[PredictionModel.WDBQF.K_WEIGHT])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.weights[PredictionModel.WDBQF.K_NON_EFFECT_ALLELE], e_w[PredictionModel.WDBQF.K_NON_EFFECT_ALLELE])
        numpy.testing.assert_array_equal(snp_model.weights[PredictionModel.WDBQF.K_EFFECT_ALLELE], e_w[PredictionModel.WDBQF.K_EFFECT_ALLELE])
开发者ID:jiamaozheng,项目名称:MetaXcan,代码行数:19,代码来源:test_prediction_model.py

示例2: _prediction_model

# 需要导入模块: import SampleData [as 别名]
# 或者: from SampleData import dataframe_from_weights [as 别名]
def _prediction_model():
    e = SampleData.dataframe_from_extra(SampleData.sample_extra_1())
    w = SampleData.dataframe_from_weights(SampleData.sample_weights_1())
    p = PredictionModel.Model(w,e)
    return p
开发者ID:torstees,项目名称:MetaXcan,代码行数:7,代码来源:test_association_calculation.py


注:本文中的SampleData.dataframe_from_weights方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。