本文整理汇总了Python中PyDSTool.prepJacobian方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python PyDSTool.prepJacobian方法的具体用法？Python PyDSTool.prepJacobian怎么用？Python PyDSTool.prepJacobian使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类PyDSTool的用法示例。
在下文中一共展示了PyDSTool.prepJacobian方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: plot
# 需要导入模块: import PyDSTool [as 别名]
# 或者: from PyDSTool import prepJacobian [as 别名]
# plot vector field
pp.plot_PP_vf(dmModel, 's1', 's2', scale_exp=-1.5)
# find dixed points of the model
fp_coord = pp.find_fixedpoints(dmModel, n=4, eps=1e-8)
# plot the null-clines
nulls_x, nulls_y = pp.find_nullclines(dmModel, 's1', 's2', n=3, \
eps=1e-8, max_step=0.01, fps=fp_coord)
plot(nulls_x[:,0], nulls_x[:,1], 'b')
plot(nulls_y[:,0], nulls_y[:,1], 'g')
# compute the jacobian matrix
jac, new_fnspecs = dst.prepJacobian(dmModel.funcspec._initargs['varspecs'],
['s1','s2'],dmModel.funcspec._initargs['fnspecs'])
scope = dst.copy(dmModel.pars)
scope.update(new_fnspecs)
jac_fn = dst.expr2fun(jac, ensure_args=['t'],**scope)
# add fixed points to the phase portrait
for i in range(0,len(fp_coord)):
fp = pp.fixedpoint_2D(dmModel, dst.Point(fp_coord[i]),
jac = jac_fn, eps=1e-8)
pp.plot_PP_fps(fp)
# compute and plot projectories
traj = dmModel.compute('trajectory1')
pts = traj.sample()
plot(pts['s1'], pts['s2'], 'r-o')