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Python PyDSTool.prepJacobian方法代码示例

本文整理汇总了Python中PyDSTool.prepJacobian方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PyDSTool.prepJacobian方法的具体用法?Python PyDSTool.prepJacobian怎么用?Python PyDSTool.prepJacobian使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在PyDSTool的用法示例。


在下文中一共展示了PyDSTool.prepJacobian方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: plot

# 需要导入模块: import PyDSTool [as 别名]
# 或者: from PyDSTool import prepJacobian [as 别名]
# plot vector field
pp.plot_PP_vf(dmModel, 's1', 's2', scale_exp=-1.5)

# find dixed points of the model
fp_coord = pp.find_fixedpoints(dmModel, n=4, eps=1e-8)

# plot the null-clines
nulls_x, nulls_y = pp.find_nullclines(dmModel, 's1', 's2', n=3, \
										eps=1e-8, max_step=0.01, fps=fp_coord)

plot(nulls_x[:,0], nulls_x[:,1], 'b')
plot(nulls_y[:,0], nulls_y[:,1], 'g')

# compute the jacobian matrix
jac, new_fnspecs = dst.prepJacobian(dmModel.funcspec._initargs['varspecs'],
			['s1','s2'],dmModel.funcspec._initargs['fnspecs'])
scope = dst.copy(dmModel.pars)
scope.update(new_fnspecs)
jac_fn = dst.expr2fun(jac, ensure_args=['t'],**scope)

# add fixed points to the phase portrait
for i in range(0,len(fp_coord)):
	fp = pp.fixedpoint_2D(dmModel, dst.Point(fp_coord[i]),
						jac = jac_fn, eps=1e-8)
	pp.plot_PP_fps(fp)

# compute and plot projectories
traj = dmModel.compute('trajectory1')
pts = traj.sample()
plot(pts['s1'], pts['s2'], 'r-o')
开发者ID:gilsho,项目名称:bioe332assign2,代码行数:32,代码来源:pplane.py


注:本文中的PyDSTool.prepJacobian方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。