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Python PhyloBuddy.hash_ids方法代码示例

本文整理汇总了Python中PhyloBuddy.hash_ids方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PhyloBuddy.hash_ids方法的具体用法?Python PhyloBuddy.hash_ids怎么用?Python PhyloBuddy.hash_ids使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在PhyloBuddy的用法示例。


在下文中一共展示了PhyloBuddy.hash_ids方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_hash_ids_edges

# 需要导入模块: import PhyloBuddy [as 别名]
# 或者: from PhyloBuddy import hash_ids [as 别名]
def test_hash_ids_edges():
    with pytest.raises(TypeError) as e:
        Pb.hash_ids(Pb.PhyloBuddy, hash_length="foo")
    assert "Hash length argument must be an integer, not <class 'str'>" in str(e)

    with pytest.raises(ValueError) as e:
        Pb.hash_ids(Pb.PhyloBuddy, hash_length=0)
    assert "Hash length must be greater than 0" in str(e)

    with pytest.raises(ValueError) as e:
        Pb.hash_ids(pb_resources.get_one("m n"), hash_length=1)
    assert "Insufficient number of hashes available to cover all sequences." in str(e)

    tester = Pb.PhyloBuddy(resource("tree_with_node_lables.nwk"))
    test_hash = phylo_to_hash(tester)
    tester = Pb.hash_ids(tester, hash_length=5, nodes=True)
    assert phylo_to_hash(tester) != test_hash
开发者ID:JamesL13,项目名称:BuddySuite,代码行数:19,代码来源:phylobuddy_test.py

示例2: test_hash_ids

# 需要导入模块: import PhyloBuddy [as 别名]
# 或者: from PhyloBuddy import hash_ids [as 别名]
def test_hash_ids(phylobuddy):
    orig_hash = phylo_to_hash(phylobuddy)
    Pb.hash_ids(phylobuddy)
    assert phylo_to_hash(phylobuddy) != orig_hash
开发者ID:JamesL13,项目名称:BuddySuite,代码行数:6,代码来源:phylobuddy_test.py


注:本文中的PhyloBuddy.hash_ids方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。