本文整理汇总了Python中Euclid.edm_to_q方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Euclid.edm_to_q方法的具体用法？Python Euclid.edm_to_q怎么用？Python Euclid.edm_to_q使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Euclid的用法示例。
在下文中一共展示了Euclid.edm_to_q方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: split_nj
# 需要导入模块: import Euclid [as 别名]
# 或者: from Euclid import edm_to_q [as 别名]
def split_nj(D):
"""
Split a distance matrix according to the neighbor joining criterion.
@param D: a distance matrix
@return: a set of two index sets defining a split of the indices
"""
n = len(D)
# there is no reason to split a 3x3 distance matrix
assert n > 3, n
Q = Euclid.edm_to_q(D)
pairs = [(i, j) for i in range(n) for j in range(n) if i < j]
best_value, best_pair = min((Q[pair], pair) for pair in pairs)
return full_split(best_pair, range(n))