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Java Node.getBranchLength方法代码示例

本文整理汇总了Java中pal.tree.Node.getBranchLength方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Java Node.getBranchLength方法的具体用法?Java Node.getBranchLength怎么用?Java Node.getBranchLength使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pal.tree.Node的用法示例。


在下文中一共展示了Node.getBranchLength方法的3个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Java代码示例。

示例1: nodeFromRoot

import pal.tree.Node; //导入方法依赖的package包/类
private Pair<Integer,Double> nodeFromRoot(Node node) {
    Node parent = node;

    int step = 0;
    double height = 0;
    while (parent != null && !parent.isRoot()) {
        step++;
        height += parent.getBranchLength();
        parent = parent.getParent();
    }

    return Pair.of(step,height);
}
 
开发者ID:tamuri,项目名称:swmutsel,代码行数:14,代码来源:BranchLengthComparer.java

示例2: printNodeInASCII

import pal.tree.Node; //导入方法依赖的package包/类
private static void printNodeInASCII(PrintWriter out, Node node, int level, int m, int maxm,
        int numExternalNodes, boolean[] umbrella, int[] position, double proportion, int minLength) {
    position[level] = (int) (node.getBranchLength() * proportion);

    if (position[level] < minLength) {
        position[level] = minLength;
    }

    if (node.isLeaf()) // external branch
    {
        if (m == maxm - 1) {
            umbrella[level - 1] = true;
        }

        printlnNodeWithNumberAndLabel(out, node, level, numExternalNodes, umbrella, position);

        if (m == 0) {
            umbrella[level - 1] = false;
        }
    } else // internal branch
    {
        for (int n = node.getChildCount() - 1; n > -1; n--) {
            printNodeInASCII(out, node.getChild(n), level + 1, n, node.getChildCount(),
                    numExternalNodes, umbrella, position, proportion, minLength);

            if (m == maxm - 1 && n == node.getChildCount() / 2) {
                umbrella[level - 1] = true;
            }

            if (n != 0) {
                if (n == node.getChildCount() / 2) {
                    printlnNodeWithNumberAndLabel(out, node, level, numExternalNodes, umbrella, position);
                } else {
                    for (int i = 0; i < level + 1; i++) {
                        if (umbrella[i]) {
                            putCharAtLevel(out, i, '|', position);
                        } else {
                            putCharAtLevel(out, i, ' ', position);
                        }
                    }
                    out.println();
                }
            }

            if (m == 0 && n == node.getChildCount() / 2) {
                umbrella[level - 1] = false;
            }
        }
    }
}
 
开发者ID:ddarriba,项目名称:jmodeltest2,代码行数:51,代码来源:TreeUtilities.java

示例3: getTreeBranchLengths

import pal.tree.Node; //导入方法依赖的package包/类
private double[] getTreeBranchLengths(List<Node> nodes) {
    double[] branchLengths = new double[nodes.size()];
    int i = 0;
    for (Node n : nodes) branchLengths[i++] = n.getBranchLength();
    return branchLengths;
}
 
开发者ID:tamuri,项目名称:swmutsel,代码行数:7,代码来源:HessianCalculator.java


注:本文中的pal.tree.Node.getBranchLength方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。