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Java CyNetwork.addNode方法代码示例

本文整理汇总了Java中org.cytoscape.model.CyNetwork.addNode方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Java CyNetwork.addNode方法的具体用法?Java CyNetwork.addNode怎么用?Java CyNetwork.addNode使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在org.cytoscape.model.CyNetwork的用法示例。


在下文中一共展示了CyNetwork.addNode方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Java代码示例。

示例1: createEntityNodes

import org.cytoscape.model.CyNetwork; //导入方法依赖的package包/类
private void createEntityNodes(CyNetwork network) {
	Set<Entity> entities = model.getObjects(Entity.class);
	for(Entity bpe: entities) {	
		// do not make nodes for top/main pathways
		if(bpe instanceof Pathway) {
			if(bpe.getParticipantOf().isEmpty()
				&& ((Process)bpe).getPathwayComponentOf().isEmpty())
				continue;
		}
		
		//  Create node symbolizing the interaction
		CyNode node = network.addNode();
		bpeToCyNodeMap.put(bpe, node);
			           
		// traverse
		createAttributesFromProperties(bpe, model, node, network);
	}
	
	if(log.isDebugEnabled())
		log.debug(network.getRow(network).get(CyNetwork.NAME, String.class) 
			+ "" + network.getNodeList().size() + " nodes created.");
}
 
开发者ID:cytoscape,项目名称:biopax,代码行数:23,代码来源:BioPaxMapper.java

示例2: createNode

import org.cytoscape.model.CyNetwork; //导入方法依赖的package包/类
public static CyNode createNode(CyNetwork network, String name, String cluster) {
	CyNode node = network.addNode();
	CyRow row = network.getRow(node);
	row.set(CyNetwork.NAME, name);
	row.set(CLUSTER_COL, cluster);
	return node;
}
 
开发者ID:BaderLab,项目名称:AutoAnnotateApp,代码行数:8,代码来源:NetworkTestUtil.java


注:本文中的org.cytoscape.model.CyNetwork.addNode方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。