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Java SeekableBufferedStream类代码示例

本文整理汇总了Java中htsjdk.samtools.seekablestream.SeekableBufferedStream的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Java SeekableBufferedStream类的具体用法?Java SeekableBufferedStream怎么用?Java SeekableBufferedStream使用的例子?那么, 这里精选的类代码示例或许可以为您提供帮助。


SeekableBufferedStream类属于htsjdk.samtools.seekablestream包,在下文中一共展示了SeekableBufferedStream类的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Java代码示例。

示例1: SAMFileReader

import htsjdk.samtools.seekablestream.SeekableBufferedStream; //导入依赖的package包/类
/**
 * Read a BAM file by http indexed query will be allowed.
 *
 * @param url
 *            BAM.
 * @param indexFile
 *            Location of index file, or null if indexed access not required.
 * @param eagerDecode
 *            eagerDecode if true, decode SAM record entirely when reading it.
 */
public SAMFileReader(final URL url, final File indexFile, final boolean eagerDecode) {
	init(new SeekableBufferedStream(new SeekableHTTPStream(url)), indexFile, eagerDecode, defaultValidationStringency);
}
 
开发者ID:NimbleGen,项目名称:bioinformatics,代码行数:14,代码来源:SAMFileReader.java


注:本文中的htsjdk.samtools.seekablestream.SeekableBufferedStream类示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。