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C# IAtomContainer.removeAllBonds方法代码示例

本文整理汇总了C#中IAtomContainer.removeAllBonds方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C# IAtomContainer.removeAllBonds方法的具体用法?C# IAtomContainer.removeAllBonds怎么用?C# IAtomContainer.removeAllBonds使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在IAtomContainer的用法示例。


在下文中一共展示了IAtomContainer.removeAllBonds方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C#代码示例。

示例1: rebond

 /// <summary> Rebonding using a Binary Space Partition Tree. Note, that any bonds
 /// defined will be deleted first. It assumes the unit of 3D space to
 /// be 1 &Acircle;ngstrom.
 /// </summary>
 public virtual void rebond(IAtomContainer container)
 {
     container.removeAllBonds();
     maxCovalentRadius = 0.0;
     // construct a new binary space partition tree
     bspt = new Bspt(3);
     IAtom[] atoms = container.Atoms;
     for (int i = atoms.Length; --i >= 0; )
     {
         IAtom atom = atoms[i];
         double myCovalentRadius = atom.CovalentRadius;
         if (myCovalentRadius == 0.0)
         {
             //throw new CDKException("Atom(s) does not have covalentRadius defined.");
         }
         else
         {
             if (myCovalentRadius > maxCovalentRadius)
                 maxCovalentRadius = myCovalentRadius;
             TupleAtom tupleAtom = new TupleAtom(atom);
             bspt.addTuple(tupleAtom);
         }
     }
     // rebond all atoms
     for (int i = atoms.Length; --i >= 0; )
     {
         bondAtom(container, atoms[i]);
     }
 }
开发者ID:xuchuansheng,项目名称:GenXSource,代码行数:33,代码来源:RebondTool.cs


注:本文中的IAtomContainer.removeAllBonds方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。