本文整理汇总了C#中IAtomContainer.removeAllBonds方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C# IAtomContainer.removeAllBonds方法的具体用法?C# IAtomContainer.removeAllBonds怎么用?C# IAtomContainer.removeAllBonds使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类IAtomContainer
的用法示例。
在下文中一共展示了IAtomContainer.removeAllBonds方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C#代码示例。
示例1: rebond
/// <summary> Rebonding using a Binary Space Partition Tree. Note, that any bonds
/// defined will be deleted first. It assumes the unit of 3D space to
/// be 1 Âle;ngstrom.
/// </summary>
public virtual void rebond(IAtomContainer container)
{
container.removeAllBonds();
maxCovalentRadius = 0.0;
// construct a new binary space partition tree
bspt = new Bspt(3);
IAtom[] atoms = container.Atoms;
for (int i = atoms.Length; --i >= 0; )
{
IAtom atom = atoms[i];
double myCovalentRadius = atom.CovalentRadius;
if (myCovalentRadius == 0.0)
{
//throw new CDKException("Atom(s) does not have covalentRadius defined.");
}
else
{
if (myCovalentRadius > maxCovalentRadius)
maxCovalentRadius = myCovalentRadius;
TupleAtom tupleAtom = new TupleAtom(atom);
bspt.addTuple(tupleAtom);
}
}
// rebond all atoms
for (int i = atoms.Length; --i >= 0; )
{
bondAtom(container, atoms[i]);
}
}