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C++ OBAtom::MemberOfRingCount方法代码示例

本文整理汇总了C++中openbabel::OBAtom::MemberOfRingCount方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ OBAtom::MemberOfRingCount方法的具体用法?C++ OBAtom::MemberOfRingCount怎么用?C++ OBAtom::MemberOfRingCount使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在openbabel::OBAtom的用法示例。


在下文中一共展示了OBAtom::MemberOfRingCount方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: newMol

OpenBabel::OBMol
Schuffenhauer::Rule_1(OpenBabel::OBMol& oldMol)
{
   	if (oldMol.GetSSSR().size() <= _ringsToBeRetained)
	{
		return oldMol;
	}
   
   	OpenBabel::OBMol newMol(oldMol);
   	std::vector<OpenBabel::OBAtom*>::iterator avi;
   	OpenBabel::OBBondIterator bi;
   	OpenBabel::OBAtom* atom;
   	OpenBabel::OBAtom* nbrAtom[2];
   	for (atom = newMol.BeginAtom(avi); atom; atom = newMol.NextAtom(avi))
   	{
      	if ((atom->MemberOfRingSize() == 3) &&
          	(atom->IsNitrogen() || atom->IsOxygen()) &&
          	(atom->MemberOfRingCount() == 1) &&
          	(atom->GetHvyValence() == 2))
      	{
         	nbrAtom[0] = atom->BeginNbrAtom(bi);
         	nbrAtom[1] = atom->NextNbrAtom(bi);
			if (nbrAtom[0] && nbrAtom[1])
			{
         		newMol.DeleteAtom(atom);
         		newMol.GetBond(nbrAtom[0], nbrAtom[1])->SetBondOrder(2);
			}
      	}
   	}
   	return newMol;
}
开发者ID:UnixJunkie,项目名称:stripper,代码行数:31,代码来源:schuffenhauer.cpp

示例2: allrings

OpenBabel::OBMol
Schuffenhauer::Rule_6(OpenBabel::OBMol& oldMol)
{
   	std::vector<OpenBabel::OBRing*> allrings(oldMol.GetSSSR());
   	if (allrings.size() <= _ringsToBeRetained)
   	{
      	return oldMol;
   	}
   
   	std::vector<OpenBabel::OBMol> mols;
   	std::vector<int> rings;
   	int size;
   	for (unsigned int i(0); i < allrings.size(); ++i)
   	{
      	size = allrings[i]->Size();
      	if ((size == 3) || (size == 5) || (size == 6))
      	{
         	mols.push_back(oldMol);
         	rings.push_back(i);
      	}
   	}
	if (mols.empty())
	{
		return oldMol;
	}

	// Only focus on ringsystems with more than one ring
   	std::vector<OpenBabel::OBAtom*>::iterator avi;
   	OpenBabel::OBAtom* atom;
	std::vector<int> fusedRings;
	for (unsigned int i(0); i < rings.size(); ++i)
	{
   		for (atom = oldMol.BeginAtom(avi); atom; atom = oldMol.NextAtom(avi))
		{
			if (allrings[rings[i]]->IsMember(atom) && (atom->MemberOfRingCount() > 1))
			{
				fusedRings.push_back(rings[i]);
				break;
			}
		}
	} 
	if (fusedRings.empty())
	{
		return oldMol;
	}
  
   	std::vector<OpenBabel::OBMol> validMols;
   	for (unsigned int i(0); i < fusedRings.size(); ++i)
   	{
      	mols[i] = RemoveRing(mols[i], allrings, fusedRings[i]);
      	if (!mols[i].Empty())
      	{
         	validMols.push_back(mols[i]);
      	}
   	}

 	if (validMols.size() == 1)
   	{
      	return validMols[0];
   	}
   	return oldMol;
}
开发者ID:UnixJunkie,项目名称:stripper,代码行数:62,代码来源:schuffenhauer.cpp


注:本文中的openbabel::OBAtom::MemberOfRingCount方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。