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C++ path_t::rend方法代码示例

本文整理汇总了C++中path_t::rend方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ path_t::rend方法的具体用法?C++ path_t::rend怎么用?C++ path_t::rend使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在path_t的用法示例。


在下文中一共展示了path_t::rend方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: if

static
void
rev_apath_to_export_md(path_t& apath,
                       const char* ref_begin,
                       const char* ref_bases,
                       const char* ref_end,
                       const char* read_bases,
                       std::string& md)
{

    // process the align path
    bool foundUnsupportedCigar = false;
    path_t::const_reverse_iterator pCRIter;
    for (pCRIter = apath.rbegin(); pCRIter != apath.rend(); ++pCRIter)
    {
        if (pCRIter->type == DELETE)
        {
            // handle deletion
            md.push_back('^');
            for (uint32_t i = 0; i < pCRIter->length; ++i, --ref_bases)
            {
                md.push_back(comp_base(*ref_bases));
            }
            md.push_back('$');

        }
        else if (pCRIter->type == INSERT)
        {
            // handle insertion
            md.push_back('^');
            md += boost::lexical_cast<std::string>(pCRIter->length);
            read_bases += pCRIter->length;
            md.push_back('$');

        }
        else if (is_segment_align_match(pCRIter->type))
        {
            // recreate the the match descriptor for this non-INDEL region
            uint32_t numMatchingBases = 0;
            for (uint32_t i = 0; i < pCRIter->length; ++i, --ref_bases, ++read_bases)
            {
                // handle circular genome
                if ((ref_bases < ref_begin) || (ref_bases > ref_end))
                {
                    md.push_back('N');
                    continue;
                }

                const char rcRefBase = comp_base(*ref_bases);

                if (rcRefBase != *read_bases)
                {

                    // write the number of preceding matching bases
                    if (numMatchingBases != 0)
                    {
                        md += boost::lexical_cast<std::string>(numMatchingBases);
                        numMatchingBases = 0;
                    }

                    // output the mismatched base
                    md.push_back(rcRefBase);

                }
                else ++numMatchingBases;
            }

            // write the number of trailing matching bases
            if (numMatchingBases != 0)
            {
                md += boost::lexical_cast<std::string>(numMatchingBases);
            }
        }
        else
        {
            // handle unsupported CIGAR operation
            foundUnsupportedCigar = true;
            break;
        }
    }

    if (foundUnsupportedCigar) md = "UNSUPPORTED";
}
开发者ID:ctb,项目名称:quast,代码行数:83,代码来源:align_path_match_descriptor.cpp


注:本文中的path_t::rend方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。