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C++ TopSegmentIteratorPtr::toReverse方法代码示例

本文整理汇总了C++中TopSegmentIteratorPtr::toReverse方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ TopSegmentIteratorPtr::toReverse方法的具体用法?C++ TopSegmentIteratorPtr::toReverse怎么用?C++ TopSegmentIteratorPtr::toReverse使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在TopSegmentIteratorPtr的用法示例。


在下文中一共展示了TopSegmentIteratorPtr::toReverse方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: checkCallBack

void TopSegmentSimpleIteratorTest::checkCallBack(const Alignment *alignment) {
    const Genome *ancGenome = alignment->openGenome("Anc0");
    CuAssertTrue(_testCase, ancGenome->getNumTopSegments() == _topSegments.size());
    TopSegmentIteratorPtr tsIt = ancGenome->getTopSegmentIterator(0);
    for (size_t i = 0; i < ancGenome->getNumTopSegments(); ++i) {
        CuAssertTrue(_testCase, (size_t)tsIt->getTopSegment()->getArrayIndex() == i);
        _topSegments[i].compareTo(tsIt, _testCase);
        tsIt->toRight();
    }
    tsIt = ancGenome->getTopSegmentIterator(ancGenome->getNumTopSegments() - 1);
    for (hal_index_t i = ancGenome->getNumTopSegments() - 1; i >= 0; --i) {
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getTopSegment()->getArrayIndex() == i);
        _topSegments[i].compareTo(tsIt, _testCase);
        tsIt->toLeft();
    }

    tsIt = ancGenome->getTopSegmentIterator(0);
    tsIt->slice(0, tsIt->getLength() - 1);
    for (hal_index_t i = 0; i < (hal_index_t)ancGenome->getSequenceLength(); ++i) {
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getLength() == 1);
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getStartPosition() == i);
        tsIt->toRight(tsIt->getStartPosition() + 1);
    }
    tsIt = ancGenome->getTopSegmentIterator(ancGenome->getNumTopSegments() - 1);
    tsIt->slice(tsIt->getLength() - 1, 0);
    for (hal_index_t i = ancGenome->getSequenceLength() - 1; i >= 0; --i) {
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getLength() == 1);
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getStartPosition() == i);
        tsIt->toLeft(tsIt->getStartPosition() - 1);
    }

    tsIt = ancGenome->getTopSegmentIterator(0);
    tsIt->toReverse();
    CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getReversed() == true);
    tsIt->slice(tsIt->getLength() - 1, 0);
    for (hal_index_t i = 0; i < (hal_index_t)ancGenome->getSequenceLength(); ++i) {
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getLength() == 1);
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getStartPosition() == i);
        tsIt->toLeft(tsIt->getStartPosition() + 1);
    }
    tsIt = ancGenome->getTopSegmentIterator(ancGenome->getNumTopSegments() - 1);
    tsIt->toReverse();
    tsIt->slice(0, tsIt->getLength() - 1);
    for (hal_index_t i = ancGenome->getSequenceLength() - 1; i >= 0; --i) {
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getLength() == 1);
        CuAssertTrue(_testCase, tsIt->getStartPosition() == i);
        tsIt->toRight(tsIt->getStartPosition() - 1);
    }
}
开发者ID:glennhickey,项目名称:hal,代码行数:49,代码来源:halTopSegmentTest.cpp


注:本文中的TopSegmentIteratorPtr::toReverse方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。