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C++ SymbolList::getAlphabet方法代码示例

本文整理汇总了C++中SymbolList::getAlphabet方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ SymbolList::getAlphabet方法的具体用法?C++ SymbolList::getAlphabet怎么用?C++ SymbolList::getAlphabet使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在SymbolList的用法示例。


在下文中一共展示了SymbolList::getAlphabet方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: getNumberOfDistinctPositionsWithoutGap

size_t getNumberOfDistinctPositionsWithoutGap(const SymbolList& l1, const SymbolList& l2) {
      if (l1.getAlphabet()->getAlphabetType() != l2.getAlphabet()->getAlphabetType()) throw AlphabetMismatchException("SymbolListTools::getNumberOfDistinctPositions.", l1.getAlphabet(), l2.getAlphabet());
      const Alphabet* alpha = l1.getAlphabet();
      int gapCode = alpha->getGapCharacterCode();
      size_t n = min(l1.size(), l2.size());
      size_t count = 0;
      for (size_t i = 0; i < n; i++) {
          int x = l1[i];
          int y = l2[i];
          if (alpha->isUnresolved(x)) x = gapCode;
          if (alpha->isUnresolved(x)) y = gapCode;
          if (x != gapCode && y != gapCode && x != y) count++;
      }
      return count;
}
开发者ID:kgori,项目名称:bpp,代码行数:15,代码来源:Alignment.cpp

示例2:

BasicSymbolList::BasicSymbolList(const SymbolList& list):
  alphabet_(list.getAlphabet()), content_(list.getContent()) {}
开发者ID:KhaosResearch,项目名称:MORPHY,代码行数:2,代码来源:SymbolList.cpp


注:本文中的SymbolList::getAlphabet方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。