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C++ Path_t::size方法代码示例

本文整理汇总了C++中Path_t::size方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Path_t::size方法的具体用法?C++ Path_t::size怎么用?C++ Path_t::size使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Path_t的用法示例。


在下文中一共展示了Path_t::size方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1:

void IterativeExtensions<span, Node, Edge, GraphDataVariant>::buildSequence (
    const Node&     node,
    const Path_t<Node>&     consensusRight,
    size_t          nbNodes,
    size_t          depth,
    Sequence&       seq
)
{
    /** Shortcuts. */
    Data&  data     = seq.getData();
    size_t lenRight = consensusRight.size();

    /** We compute the total size of the sequence. */
    size_t fullLength = graph.getKmerSize() + consensusRight.size();

    /* we need this in mapsembler: the first used kmer should be a k-1 mer. Indeed, if a first kmer is extracted from a sequence :
     * -------------****** (k=6), then this node is the one linked to a new one starting with ******,
     * thus with an overlap of k and not k-1.
     */
    size_t offset = (depth == 0 && dont_output_first_nucleotide) ? 1 : 0;

    /** We compute the total size of the sequence. */
    size_t length = fullLength - offset;

    /** We set the comment of the sequence. */
    seq.setComment (Stringify::format ("%lli__len__%i__depth__%i", nbNodes, fullLength, depth) );

    /** We set the data length. */
    seq.getData().resize (length);

    size_t idx=0;
    size_t i = offset;

    /** We dump the starting node. */
    string nodeStr = graph.toString (node);
    for ( ; i<nodeStr.size(); i++)  { data[idx++] = nodeStr[i]; }

    /** We dump the right part. */
    for (i=0; i<lenRight; i++)  {  data[idx++] = ascii (consensusRight[i]); }
}
开发者ID:pombredanne,项目名称:gatb-core,代码行数:40,代码来源:IterativeExtensions.cpp


注:本文中的Path_t::size方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。