本文整理汇总了C++中PDBFile::Atoms方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ PDBFile::Atoms方法的具体用法？C++ PDBFile::Atoms怎么用？C++ PDBFile::Atoms使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类PDBFile的用法示例。
在下文中一共展示了PDBFile::Atoms方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: main
int main () {
PDBFile pdb ("octadecane.pdb");
//MDSystem::Dimensions(VecR(29.868, 100.0, 27.792));
Atom_ptr_vec& atoms = pdb.Atoms();
printf ("!entry.xxx.unit.connectivity table int atom1x int atom2x int flags\n");
/* cycle through each atom in order of the pdb file */
for (int i = 0; i != atoms.size() - 1; i++)
{
for (int j = i+1; j != atoms.size(); j++)
{
//double distance = MDSystem::Distance(atoms[i],atoms[j]).Magnitude();
double distance = (atoms[i]->Position() - atoms[j]->Position()).Magnitude();
if (distance < 1.7)
{
printf (" %d %d 1\n", i+1, j+1);
}
}
}
return 0;
}