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C++ OptionParser::prog方法代码示例

本文整理汇总了C++中OptionParser::prog方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ OptionParser::prog方法的具体用法?C++ OptionParser::prog怎么用?C++ OptionParser::prog使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在OptionParser的用法示例。


在下文中一共展示了OptionParser::prog方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: PrepareHeader

BamHeader PrepareHeader(const OptionParser& parser, int argc, char** argv,
                        const vector<string>& files)
{
    using boost::algorithm::join;

    ProgramInfo program(parser.prog() + "-" + CCS_VERSION);
    program.Name(parser.prog())
    .CommandLine(parser.prog() + " " + join(vector<string>(argv + 1, argv + argc), " "))
    .Description(DESCRIPTION)
    .Version(CCS_VERSION);

    BamHeader header;
    header.PacBioBamVersion("3.0.1").SortOrder("unknown").Version("1.5").AddProgram(program);

    for (const auto& file : files) {
        BamFile bam(file);

        for (const auto& rg : bam.Header().ReadGroups()) {
            if (rg.ReadType() != "SUBREAD")
                parser.error("invalid input file, READTYPE must be SUBREAD");

            ReadGroupInfo readGroup(rg.MovieName(), "CCS");
            readGroup.BindingKit(rg.BindingKit())
            .SequencingKit(rg.SequencingKit())
            .BasecallerVersion(rg.BasecallerVersion())
            .FrameRateHz(rg.FrameRateHz());

            header.AddReadGroup(readGroup);
        }
    }

    return header;
}
开发者ID:ylipacbio,项目名称:pbccs,代码行数:33,代码来源:ccs.cpp


注:本文中的OptionParser::prog方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。