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C++ NonbondedForce::getLJPMEParameters方法代码示例

本文整理汇总了C++中NonbondedForce::getLJPMEParameters方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ NonbondedForce::getLJPMEParameters方法的具体用法?C++ NonbondedForce::getLJPMEParameters怎么用?C++ NonbondedForce::getLJPMEParameters使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在NonbondedForce的用法示例。


在下文中一共展示了NonbondedForce::getLJPMEParameters方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: calcPMEParameters

void NonbondedForceImpl::calcPMEParameters(const System& system, const NonbondedForce& force, double& alpha, int& xsize, int& ysize, int& zsize, bool lj) {
    if (lj)
        force.getLJPMEParameters(alpha, xsize, ysize, zsize);
    else
        force.getPMEParameters(alpha, xsize, ysize, zsize);
    if (alpha == 0.0) {
        Vec3 boxVectors[3];
        system.getDefaultPeriodicBoxVectors(boxVectors[0], boxVectors[1], boxVectors[2]);
        double tol = force.getEwaldErrorTolerance();
        alpha = (1.0/force.getCutoffDistance())*std::sqrt(-log(2.0*tol));
        if (lj) {
            xsize = (int) ceil(alpha*boxVectors[0][0]/(3*pow(tol, 0.2)));
            ysize = (int) ceil(alpha*boxVectors[1][1]/(3*pow(tol, 0.2)));
            zsize = (int) ceil(alpha*boxVectors[2][2]/(3*pow(tol, 0.2)));
        }
        else {
            xsize = (int) ceil(2*alpha*boxVectors[0][0]/(3*pow(tol, 0.2)));
            ysize = (int) ceil(2*alpha*boxVectors[1][1]/(3*pow(tol, 0.2)));
            zsize = (int) ceil(2*alpha*boxVectors[2][2]/(3*pow(tol, 0.2)));
        }
        xsize = max(xsize, 6);
        ysize = max(ysize, 6);
        zsize = max(zsize, 6);
    }
}
开发者ID:bas-rustenburg,项目名称:openmm,代码行数:25,代码来源:NonbondedForceImpl.cpp


注:本文中的NonbondedForce::getLJPMEParameters方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。