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C++ Lattice::delta方法代码示例

本文整理汇总了C++中Lattice::delta方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Lattice::delta方法的具体用法?C++ Lattice::delta怎么用?C++ Lattice::delta使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Lattice的用法示例。


在下文中一共展示了Lattice::delta方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: doWork

void ComputeDPME::doWork()
{
  DebugM(4,"Entering ComputeDPME::doWork().\n");

  Pme2Particle *localData;

  ResizeArrayIter<PatchElem> ap(patchList);

  // Skip computations if nothing to do.
  if ( ! patchList[0].p->flags.doFullElectrostatics )
  {
    for (ap = ap.begin(); ap != ap.end(); ap++) {
      CompAtom *x = (*ap).positionBox->open();
      Results *r = (*ap).forceBox->open();
      (*ap).positionBox->close(&x);
      (*ap).forceBox->close(&r);
    }
    if ( master ) {
      master->reduction->submit();
    }
    return;
  }

  // allocate storage
  numLocalAtoms = 0;
  for (ap = ap.begin(); ap != ap.end(); ap++) {
    numLocalAtoms += (*ap).p->getNumAtoms();
  }

  Lattice lattice = patchList[0].p->flags.lattice;

  localData = new Pme2Particle[numLocalAtoms];  // given to message

  // get positions and charges
  Pme2Particle * data_ptr = localData;
  const BigReal coulomb_sqrt = sqrt( COULOMB * ComputeNonbondedUtil::scaling
				* ComputeNonbondedUtil::dielectric_1 );
  for (ap = ap.begin(); ap != ap.end(); ap++) {
    CompAtom *x = (*ap).positionBox->open();
    if ( patchList[0].p->flags.doMolly ) {
      (*ap).positionBox->close(&x);
      x = (*ap).avgPositionBox->open();
    }
    int numAtoms = (*ap).p->getNumAtoms();

    for(int i=0; i<numAtoms; ++i)
    {
      Vector tmp = lattice.delta(x[i].position);
      data_ptr->x = tmp.x;
      data_ptr->y = tmp.y;
      data_ptr->z = tmp.z;
      data_ptr->cg = coulomb_sqrt * x[i].charge;
      data_ptr->id = x[i].id;
      ++data_ptr;
    }

    if ( patchList[0].p->flags.doMolly ) { (*ap).avgPositionBox->close(&x); }
    else { (*ap).positionBox->close(&x); }
  }

  // send data to master
  ComputeDPMEDataMsg *msg = new ComputeDPMEDataMsg;
  msg->node = CkMyPe();
  msg->numParticles = numLocalAtoms;
  msg->particles = localData;
  comm->sendComputeDPMEData(msg);
}
开发者ID:aar2163,项目名称:NAMD-energy,代码行数:67,代码来源:ComputeDPME.C


注:本文中的Lattice::delta方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。