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C++ Grammar::subSeqInsideProb方法代码示例

本文整理汇总了C++中Grammar::subSeqInsideProb方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Grammar::subSeqInsideProb方法的具体用法?C++ Grammar::subSeqInsideProb怎么用?C++ Grammar::subSeqInsideProb使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Grammar的用法示例。


在下文中一共展示了Grammar::subSeqInsideProb方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: mkStrPredRecord

PredRecord mkStrPredRecord(Grammar const & g, string const & entryId, unsigned begin, unsigned end, string const & fold, vector_t const & posScore)
{
    PredRecord pr;
    pr.id                = entryId;
    pr.begin             = begin;
    pr.end               = end;
    pr.cykProbStr        = g.subSeqCykProb(g.stateIndex(STR_BEGIN), begin, end);
    pr.cykProbNoStr      = g.subSeqCykProb(g.stateIndex(NON_STR_BEGIN), begin, end);
    pr.insideProbStr     = g.subSeqInsideProb(g.stateIndex(STR_BEGIN), begin, end);
    pr.insideProbNoStr   = g.subSeqInsideProb(g.stateIndex(NON_STR_BEGIN), begin, end);
    pr.cykScore          = (pr.cykProbNoStr != 0) ? log(pr.cykProbStr / pr.cykProbNoStr) : INFINITY;
    pr.score             = (pr.insideProbNoStr != 0) ? log(pr.insideProbStr / pr.insideProbNoStr) : INFINITY;
    if (pr.cykProbStr !=0)
      if (pr.insideProbStr != 0)
	pr.strPostProb       = toNumber(pr.cykProbStr / pr.insideProbStr);
      else // denom = 0
	pr.strPostProb = INFINITY;
    else
      pr.strPostProb = 0;
    pr.fold              = string(fold, begin, end - begin);
    pr.bpCount           = countBasePairs(fold);
    pr.posScore.resize(end - begin);
    for (unsigned i = 0; i < end - begin; i++)
      pr.posScore[i] = posScore[i + begin];
    return pr;
}
开发者ID:jakob-skou-pedersen,项目名称:phy,代码行数:26,代码来源:EvoFold.cpp


注:本文中的Grammar::subSeqInsideProb方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。