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C++ EList::sortPortion方法代码示例

本文整理汇总了C++中EList::sortPortion方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ EList::sortPortion方法的具体用法?C++ EList::sortPortion怎么用?C++ EList::sortPortion使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在EList的用法示例。


在下文中一共展示了EList::sortPortion方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: invertPoss

/**
 * Flip all the edits.pos fields so that they're with respect to
 * the other end of the read (of length 'sz').
 */
void Edit::invertPoss(
	EList<Edit>& edits,
	size_t sz,
	size_t ei,
	size_t en,
	bool sort)
{
	// Invert elements
	size_t ii = 0;
	for(size_t i = ei; i < ei + en/2; i++) {
		Edit tmp = edits[i];
		edits[i] = edits[ei + en - ii - 1];
		edits[ei + en - ii - 1] = tmp;
		ii++;
	}
	for(size_t i = ei; i < ei + en; i++) {
		assert(edits[i].pos < sz ||
			   (edits[i].isReadGap() && edits[i].pos == sz));
		// Adjust pos
        if(edits[i].isReadGap() || edits[i].isSpliced()) {
            edits[i].pos = (uint32_t)(sz - edits[i].pos);
        } else {
            edits[i].pos = (uint32_t)(sz - edits[i].pos - 1);
        }
		// Adjust pos2
		if(edits[i].isReadGap()) {
			int64_t pos2diff = (int64_t)(uint64_t)edits[i].pos2 - (int64_t)((uint64_t)std::numeric_limits<uint32_t>::max() >> 1);
			int64_t pos2new = (int64_t)(uint64_t)edits[i].pos2 - 2*pos2diff;
			assert(pos2diff == 0 || (uint32_t)pos2new != (std::numeric_limits<uint32_t>::max() >> 1));
			edits[i].pos2 = (uint32_t)pos2new;
		}
	}
	if(sort) {
		// Edits might not necessarily be in same order after inversion
		edits.sortPortion(ei, en);
#ifndef NDEBUG
		for(size_t i = ei + 1; i < ei + en; i++) {
			assert_geq(edits[i].pos, edits[i-1].pos);
		}
#endif
	}
}
开发者ID:BenLangmead,项目名称:hisat,代码行数:46,代码来源:edit.cpp


注:本文中的EList::sortPortion方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。