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C++ DNASequence::isNull方法代码示例

本文整理汇总了C++中DNASequence::isNull方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ DNASequence::isNull方法的具体用法?C++ DNASequence::isNull怎么用?C++ DNASequence::isNull使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在DNASequence的用法示例。


在下文中一共展示了DNASequence::isNull方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: tick

Task* PWMatrixSearchWorker::tick() {
    while (modelPort->hasMessage()) {
        models << modelPort->get().getData().toMap().value(PWMatrixWorkerFactory::WMATRIX_SLOT.getId()).value<PWMatrix>();
    }
    if (!modelPort->isEnded()) {
        return NULL;
    }

    if (dataPort->hasMessage()) {
        Message inputMessage = getMessageAndSetupScriptValues(dataPort);
        if (inputMessage.isEmpty() || models.isEmpty()) {
            output->transit();
            return NULL;
        }
        QVariantMap map = inputMessage.getData().toMap();
        SharedDbiDataHandler seqId = map.value(BaseSlots::DNA_SEQUENCE_SLOT().getId()).value<SharedDbiDataHandler>();
        QScopedPointer<U2SequenceObject> seqObj(StorageUtils::getSequenceObject(context->getDataStorage(), seqId));
        if (seqObj.isNull()) {
            return NULL;
        }
        U2OpStatusImpl os;
        DNASequence seq = seqObj->getWholeSequence(os);
        CHECK_OP(os, new FailTask(os.getError()));

        if (!seq.isNull() && seq.alphabet->getType() == DNAAlphabet_NUCL) {
            WeightMatrixSearchCfg config(cfg);
            config.complOnly = (strand < 0);
            if (strand <= 0) {
                DNATranslation* compTT = AppContext::getDNATranslationRegistry()->
                    lookupComplementTranslation(seq.alphabet);
                if (compTT  != NULL) {
                    config.complTT = compTT  ;
                }
            }
            QList<Task*> subtasks;
            foreach(PWMatrix model, models) {
                subtasks << new WeightMatrixSingleSearchTask(model, seq.seq, config, 0);
            }
开发者ID:ugeneunipro,项目名称:ugene,代码行数:38,代码来源:WeightMatrixSearchWorker.cpp


注:本文中的DNASequence::isNull方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。