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C++ DNA::slice方法代码示例

本文整理汇总了C++中DNA::slice方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ DNA::slice方法的具体用法?C++ DNA::slice怎么用?C++ DNA::slice使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在DNA的用法示例。


在下文中一共展示了DNA::slice方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: FrequentWords

vector<DNA<false>> FrequentWords(const DNA<IsCyclic>& dnaString, int k) {
  //Initialize dictionary
  unordered_map<DNA<false>, int> counts{ };
  size_t n{ dnaString.size() };

  //Fill dictionary and count kmer frequencies
  int maxCount{ 1 };
  for (size_t i = 0; i < n - k + 1; i++) {
    DNA<false> part{ dnaString.slice(i, k) };
    auto it = counts.find(part);
    if (it == end(counts)) { 
      counts[part] = 1; 
    } else { 
      it->second++; 
      if (maxCount < it->second) maxCount = it->second;
    };
  };

  //Extract most frequent words
  vector<DNA<false>> most_frequent_words{ };
  for (auto& p : counts) if (p.second == maxCount) most_frequent_words.push_back(p.first);

  return most_frequent_words;
};
开发者ID:mrpejker,项目名称:BioCode,代码行数:24,代码来源:FrequentWords.hpp


注:本文中的DNA::slice方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。