本文整理汇总了C++中ContigPath::swap方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ ContigPath::swap方法的具体用法？C++ ContigPath::swap怎么用？C++ ContigPath::swap使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ContigPath的用法示例。
在下文中一共展示了ContigPath::swap方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: mergePaths
/** Attempt to merge the paths specified in mergeQ with path.
* @return the number of paths merged
*/
static unsigned mergePaths(const Lengths& lengths,
ContigPath& path,
deque<ContigNode>& mergeQ, set<ContigNode>& seen,
const ContigPathMap& paths)
{
unsigned merged = 0;
deque<ContigNode> invalid;
for (ContigNode pivot; !mergeQ.empty(); mergeQ.pop_front()) {
pivot = mergeQ.front();
ContigPathMap::const_iterator path2It
= paths.find(pivot.contigIndex());
if (path2It == paths.end())
continue;
ContigPath path2 = path2It->second;
if (pivot.sense())
reverseComplement(path2.begin(), path2.end());
ContigPath consensus = align(lengths, path, path2, pivot);
if (consensus.empty()) {
invalid.push_back(pivot);
continue;
}
appendToMergeQ(mergeQ, seen, path2);
path.swap(consensus);
if (gDebugPrint)
#pragma omp critical(cout)
cout << get(g_contigNames, pivot)
<< '\t' << path2 << '\n'
<< '\t' << path << '\n';
merged++;
}
mergeQ.swap(invalid);
return merged;
}