本文整理汇总了C++中ContigNode::ambiguousSequence方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ ContigNode::ambiguousSequence方法的具体用法？C++ ContigNode::ambiguousSequence怎么用？C++ ContigNode::ambiguousSequence使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ContigNode的用法示例。
在下文中一共展示了ContigNode::ambiguousSequence方法的2个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: sequence
/** Return the sequence of the specified contig node. The sequence
* may be ambiguous or reverse complemented.
*/
static Sequence sequence(const Contigs& contigs, const ContigNode& id)
{
if (id.ambiguous()) {
string s(id.ambiguousSequence());
if (s.length() < opt::k)
transform(s.begin(), s.end(), s.begin(), ::tolower);
return string(opt::k - 1, 'N') + s;
} else {
const Sequence& seq = contigs[id.id()].seq;
return id.sense() ? reverseComplement(seq) : seq;
}
}示例2: s
/** Return the sequence of the specified contig node. The sequence
* may be ambiguous or reverse complemented.
*/
static const Sequence getSequence(ContigNode id)
{
if (id.ambiguous()) {
string s(id.ambiguousSequence());
if (s.length() < opt::k)
transform(s.begin(), s.end(), s.begin(), ::tolower);
return string(opt::k - 1, 'N') + s;
} else {
string seq(g_contigs[id.id()]);
return id.sense() ? reverseComplement(seq) : seq;
}
}