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C++ Chromosome::getSeqLen方法代码示例

本文整理汇总了C++中Chromosome::getSeqLen方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Chromosome::getSeqLen方法的具体用法?C++ Chromosome::getSeqLen怎么用?C++ Chromosome::getSeqLen使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Chromosome的用法示例。


在下文中一共展示了Chromosome::getSeqLen方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: createSequencesInGraph

void Graph::createSequencesInGraph(const Chromosome &chromo)
{
    seqLen_t start = 0;
    seqLen_t end = chromo.getSeqLen();

    for(Node *node : previousState)
        if(node)
            nodMan.markAncestrialMaterial(*node, start, end);

    for(Node *node : previousState)
        if(node)
            nodMan.determineCoalescentNodes(node);


    nodMan.initBvMeaning();
    nodMan.computeOptimalRefed();

    // a slight hack to initialize the dummy node
    nat numNeutMut = getBvMeaning().size();
    NodeExtraInfo *info = nodMan.getInfo(0);
    info->bv = new BitSetSeq(numNeutMut);

    for(nat i = 0; i < previousState.size(); ++i)
    {
        Node *node = previousState[i];

#ifdef DEBUG_SEQUENCE_EXTRACTION
        cout << "starting extraction for sequence "  << i << "\t" << previousState.size() << endl;
#endif

        if(node)
            nodMan.createSequenceForNode(node);
    }
}
开发者ID:aberer,项目名称:AnA-FiTS,代码行数:34,代码来源:Graph.cpp


注:本文中的Chromosome::getSeqLen方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。