本文整理汇总了C++中CMol::LangevinDynamics方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ CMol::LangevinDynamics方法的具体用法？C++ CMol::LangevinDynamics怎么用？C++ CMol::LangevinDynamics使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类CMol的用法示例。
在下文中一共展示了CMol::LangevinDynamics方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: Gen_Soft_Dihedral_List_MD_High_T
void Gen_Soft_Dihedral_List_MD_High_T(void)
{
int Step, Idx, RecIdx, iPos, ia, ib, ic, id;
Mol.Init_LangevinDynamics(T_Sim);
nDihedral = Mol.nDihedral;
for(Step=1; Step<=MAX_STEP; Step++) {
Mol.LangevinDynamics(Step);
if(Step%GAP==0) {
RecIdx = Step/GAP - 1;
for(Idx=0; Idx<nDihedral; Idx++) {
dih_List[RecIdx][Idx] = Mol.dih_Phi_List[Idx];
}
}
}
Cal_Sig();
Cal_Sig_Shift_PI2();
n_Soft_Dih = 0;
for(Idx=0; Idx<nDihedral; Idx++) {
if(IsRigidDih[Idx] == 0) {
iPos = Idx*4;
ia = Mol.DihedralList[iPos ];
ib = Mol.DihedralList[iPos+1];
ic = Mol.DihedralList[iPos+2];
id = Mol.DihedralList[iPos+3];
if(ib <= ic) {
if(!Is_In_Soft_Dihedral_List(ib, ic)) {
Dih_Bond[n_Soft_Dih][0] = ia;
Dih_Bond[n_Soft_Dih][1] = ib;
Dih_Bond[n_Soft_Dih][2] = ic;
Dih_Bond[n_Soft_Dih][3] = id;
n_Soft_Dih++;
printf("%3d %3d %3d %3d \n", Mol.DihedralList[iPos]+1, Mol.DihedralList[iPos+1]+1, Mol.DihedralList[iPos+2]+1, Mol.DihedralList[iPos+3]+1);
}
}
else {
if(!Is_In_Soft_Dihedral_List(ic, ib)) {
Dih_Bond[n_Soft_Dih][0] = id;
Dih_Bond[n_Soft_Dih][1] = ic;
Dih_Bond[n_Soft_Dih][2] = ib;
Dih_Bond[n_Soft_Dih][3] = ia;
n_Soft_Dih++;
printf("%3d %3d %3d %3d \n", Mol.DihedralList[iPos]+1, Mol.DihedralList[iPos+1]+1, Mol.DihedralList[iPos+2]+1, Mol.DihedralList[iPos+3]+1);
}
}
}
}
}