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C++ Bond::getEndAtomIdx方法代码示例

本文整理汇总了C++中Bond::getEndAtomIdx方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Bond::getEndAtomIdx方法的具体用法?C++ Bond::getEndAtomIdx怎么用?C++ Bond::getEndAtomIdx使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Bond的用法示例。


在下文中一共展示了Bond::getEndAtomIdx方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: setReactantBondPropertiesToProduct

void setReactantBondPropertiesToProduct(RWMOL_SPTR product,
                                        const ROMol &reactant,
                                        ReactantProductAtomMapping *mapping) {
  ROMol::BOND_ITER_PAIR bondItP = product->getEdges();
  while (bondItP.first != bondItP.second) {
    Bond *pBond = (*product)[*(bondItP.first)];
    ++bondItP.first;
    if (pBond->hasProp(common_properties::NullBond) ||
        pBond->hasProp(common_properties::_MolFileBondQuery)) {
      if (mapping->prodReactAtomMap.find(pBond->getBeginAtomIdx()) !=
              mapping->prodReactAtomMap.end() &&
          mapping->prodReactAtomMap.find(pBond->getEndAtomIdx()) !=
              mapping->prodReactAtomMap.end()) {
        // the bond is between two mapped atoms from this reactant:
        unsigned begIdx = mapping->prodReactAtomMap[pBond->getBeginAtomIdx()];
        unsigned endIdx = mapping->prodReactAtomMap[pBond->getEndAtomIdx()];
        const Bond *rBond = reactant.getBondBetweenAtoms(begIdx, endIdx);
        if (!rBond) continue;
        pBond->setBondType(rBond->getBondType());
        pBond->setBondDir(rBond->getBondDir());
        pBond->setIsAromatic(rBond->getIsAromatic());
        if (pBond->hasProp(common_properties::NullBond)) {
          pBond->clearProp(common_properties::NullBond);
        }
      }
    }
  }
}
开发者ID:rdkit,项目名称:rdkit,代码行数:28,代码来源:ReactionRunner.cpp

示例2: addMissingProductBonds

void addMissingProductBonds(const Bond &origB, RWMOL_SPTR product,
                            ReactantProductAtomMapping *mapping) {
  unsigned int begIdx = origB.getBeginAtomIdx();
  unsigned int endIdx = origB.getEndAtomIdx();

  std::vector<unsigned> prodBeginIdxs = mapping->reactProdAtomMap[begIdx];
  std::vector<unsigned> prodEndIdxs = mapping->reactProdAtomMap[endIdx];
  CHECK_INVARIANT(prodBeginIdxs.size() == prodEndIdxs.size(),
                  "Different number of start-end points for product bonds.");
  for (unsigned i = 0; i < prodBeginIdxs.size(); i++) {
    setNewProductBond(origB, product, prodBeginIdxs.at(i), prodEndIdxs.at(i));
  }
}
开发者ID:rdkit,项目名称:rdkit,代码行数:13,代码来源:ReactionRunner.cpp


注:本文中的Bond::getEndAtomIdx方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。