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C++ AlignmentPtr::open方法代码示例

本文整理汇总了C++中AlignmentPtr::open方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ AlignmentPtr::open方法的具体用法?C++ AlignmentPtr::open怎么用?C++ AlignmentPtr::open使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在AlignmentPtr的用法示例。


在下文中一共展示了AlignmentPtr::open方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1:

TempReadAlignment::TempReadAlignment(AlignmentPtr alignment, 
                                     char* path)
  : _path(path)
{
  alignment->close();
  alignment->open(_path, true);
  _alignment = alignment;
}
开发者ID:BioinformaticsArchive,项目名称:hal,代码行数:8,代码来源:halAlignmentTest.cpp

示例2: createCallBack

void GenomeUpdateTest::createCallBack(AlignmentPtr alignment)
{
  hal_size_t alignmentSize = alignment->getNumGenomes();
  CuAssertTrue(_testCase, alignmentSize == 0);
  
  Genome* ancGenome = alignment->addRootGenome("AncGenome", 0);
  vector<Sequence::Info> seqVec(1);
  seqVec[0] = Sequence::Info("Sequence", 1000000, 5000, 700000);
  ancGenome->setDimensions(seqVec);  
  alignment->close();

  alignment->open(_createPath, false);
  ancGenome = alignment->openGenome("AncGenome");
  seqVec[0] = Sequence::Info("Sequence", 10000005, 14000, 2000001);
  ancGenome->setDimensions(seqVec);  
}
开发者ID:BioinformaticsArchive,项目名称:hal,代码行数:16,代码来源:halGenomeTest.cpp


注:本文中的AlignmentPtr::open方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。