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R recipes step_BoxCox 非負數據的 Box-Cox 變換


step_BoxCox() 創建配方步驟的規範,該步驟將使用 Box-Cox 轉換來轉換數據。

用法

step_BoxCox(
  recipe,
  ...,
  role = NA,
  trained = FALSE,
  lambdas = NULL,
  limits = c(-5, 5),
  num_unique = 5,
  skip = FALSE,
  id = rand_id("BoxCox")
)

參數

recipe

一個菜譜對象。該步驟將添加到此配方的操作序列中。

...

一個或多個選擇器函數用於為此步驟選擇變量。有關更多詳細信息,請參閱selections()

role

由於沒有創建新變量,因此此步驟未使用。

trained

指示預處理數量是否已估計的邏輯。

lambdas

變換值的數值向量。在由 prep() 計算之前,這是 NULL

limits

長度為 2 的數值向量,定義計算變換參數 lambda 的範圍。

num_unique

一個整數,用於指定評估轉換所需的最小唯一值。

skip

一個合乎邏輯的。當bake() 烘焙食譜時是否應該跳過此步驟?雖然所有操作都是在 prep() 運行時烘焙的,但某些操作可能無法對新數據進行(例如處理結果變量)。使用skip = TRUE時應小心,因為它可能會影響後續操作的計算。

id

該步驟特有的字符串,用於標識它。

recipe 的更新版本,將新步驟添加到任何現有操作的序列中。

細節

Box-Cox 變換需要嚴格為正的變量,可用於重新調整變量以使其更類似於正態分布。在此包中,部分對數似然函數在一組合理的變換值(可由用戶更改)內直接優化。

這種轉換通常是使用統計模型(例如普通最小二乘法)的殘差對結果變量進行的。這裏,使用簡單的空模型(僅截距)將變換單獨應用於預測變量。這可以使變量分布更加對稱。

如果估計變換參數非常接近邊界,或者優化失敗,則使用值 NA 並且不應用變換。

整理

當您 tidy() 此步驟時,將返回包含列 terms(選擇的選擇器或變量)和 value(lambda 估計值)的 tibble。

箱重

底層操作不允許使用案例權重。

參考

薩基亞,R.M. (1992)。 Box-Cox 轉換技術:回顧。統計學家,169-178..

也可以看看

例子


rec <- recipe(~., data = as.data.frame(state.x77))

bc_trans <- step_BoxCox(rec, all_numeric())

bc_estimates <- prep(bc_trans, training = as.data.frame(state.x77))
#> Warning: Non-positive values in selected variable.
#> Warning: No Box-Cox transformation could be estimated for: `Frost`

bc_data <- bake(bc_estimates, as.data.frame(state.x77))

plot(density(state.x77[, "Illiteracy"]), main = "before")

plot(density(bc_data$Illiteracy), main = "after")


tidy(bc_trans, number = 1)
#> # A tibble: 1 × 3
#>   terms         value id          
#>   <chr>         <dbl> <chr>       
#> 1 all_numeric()    NA BoxCox_0O2vM
tidy(bc_estimates, number = 1)
#> # A tibble: 7 × 3
#>   terms          value id          
#>   <chr>          <dbl> <chr>       
#> 1 Population  0.000966 BoxCox_0O2vM
#> 2 Income      0.524    BoxCox_0O2vM
#> 3 Illiteracy -0.379    BoxCox_0O2vM
#> 4 Life Exp    4.59     BoxCox_0O2vM
#> 5 Murder      0.606    BoxCox_0O2vM
#> 6 HS Grad     1.92     BoxCox_0O2vM
#> 7 Area        0.250    BoxCox_0O2vM
源代碼:R/BoxCox.R

相關用法


注:本文由純淨天空篩選整理自Max Kuhn等大神的英文原創作品 Box-Cox Transformation for Non-Negative Data。非經特殊聲明,原始代碼版權歸原作者所有,本譯文未經允許或授權,請勿轉載或複製。